"Der letzte Metroid ist in Gefangenschaft. Die Galaxis ist in Frieden..." Wir betreten Samus Arans Varia-Anzug, um die ersten Momente des SNES-Meisterwerks noch einmal zu erleben, während der Kopfgeldjäger sich an die Ereignisse von Metroid 1 und 2 erinnert, versucht, das Metroid-Kind/die Larve vor Ridleys Krallen an der Galaktischen Forschungsstation in Ceres (Weltraumkolonie) zu schützen und schließlich ihre Reise auf dem Planeten Zebes von Crateria bis Brinstar beginnt. wo sie die Morphing-Kugel und die Raketen zurückholt, um sich durch die ersten Weltraumpiraten zu schießen.