Milenio 3 fue un programa de radio nocturno español, dirigido y presentado por Iker Jiménez, que se emitió en las madrugadas del sábado al domingo en la Cadena SER. En él se trataban temas relacionados con el denominado periodismo del misterio o periodismo de lo desconocido: misterios no resueltos, fenómenos paranormales, sucesos extraños, enigmas y leyendas, historia antigua, ciencia, etc. Desde 2005, Milenio 3 contó con un programa hermano, titulado Cuarto milenio y capitaneado por el mismo equipo, en el canal de televisión Cuatro.