Инфекции и дисбиоз критически влияют на ХОБЛ и ИПФ. Ось кишечник–легкие связывает микробиоту с иммунным статусом. Герпесвирусы и бактерии (напр. Streptococcus) провоцируют обострения. Метаболиты кишечника, такие как КЦЖК, важны для защиты тканей и снижения воспаления.