Com experiência na área de História, com ênfase em História Contemporânea, Ferla atua principalmente nas temáticas sobre fenômenos da modernidade, história da ciência, história do corpo e história da cidade. Atualmente, desenvolve pesquisas voltadas à utilização de novas tecnologias digitais no trabalho do historiador. É coordenador do Grupo de Pesquisas Hímaco e do lab.hum - Laboratório de Humanidades Digitais da UNIFESP. Além disso, coordena o Projeto Pauliceia 2.0: Mapeamento Colaborativo da História de São Paulo.