Non è possibile stabilire oggi il giorno e il mese esatto della fondazione dell’Abbazia di Santa Maria ma è possibile dire che la fondazione corrisponde al momento in cui San Nilo riceve in dono da Gregorio I, Conte di Tuscolo, Senator Romanorum e figlio di Alberico II, un vasto territorio dove sono presenti i resti degli edifici di una antica villa di epoca romana datati al I secolo a.C. e da alcuni studiosi attribuiti alla villa tuscolana di Cicerone, certamente ancora in condizione di essere utilizzati. San Bartolomeo, discepolo prediletto di San Nilo, narra infatti che il Santo, giunto nel territorio della città di Tuscolo, viene ospitato nel monastero di Sant’Agata prossimo al castello della Molara, probabilmente fondato nell’anno 370 dell’era volgare dall’Abate Giovanni di Cappadocia, discepolo di San Basilio.