December 21, 2020

86. Mysterious Defense Islands

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バクテリアで35年前に発見されたレトロンと呼ばれる謎の因子の機能に大胆に迫った論文を読みました。Show notes

Bacterial Retrons Function In Anti-Phage Defense. Millman et al Cell 2020…これが今回紹介するレトロンの論文です。

細菌の逆転写酵素およびmsDNAの構造と機能 (日本細菌学雑誌, pdf)…日本語で読めるレトロンの機能などに関する総説論文。

逆転写酵素 (Wikipedia)

Genomically encoded analog memory with precise in vivo DNA writing in living cell populations. Science 2014…この論文で初めてレトロンの一部の領域が自在に改変でき、大腸菌の集団に外部刺激を記録するツールとして転用された。

Functional Genetic Variants Revealed by Massively Parallel Precise Genome Editing. Cell 2018…この論文ではレトロンを改造し、相同組み替えのドナーDNAをガイドRNAと同時に細胞へ導入する新しいゲノム編集法として転用された。

RNaseH (Wikipedia)

制限酵素についてはエピソード72で詳しく話しました。

ウイルスプラーク (Wikipedia)

バクテリオファージT4とT7

Anti-CRISPR protein applications: natural brakes for CRISPR-Cas technologies. Nature Methods…Anti-CRISPRタンパク質に関するレビュー論文。

フレームシフト変異 (Wikipedia)

RecBCD (Wikipedia)

Ediorial notes

Defense islandで宝探しをしよう！ (soh)

レトロンって名前がかっこいい。fugafuga-tronっていう名前に憧れる。イントロン、レトロン、ウルトロン(tadasu)

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