การกำจัดขยะอินทรีย์มีหลายวิธี เช่น การเผา การหมักด้วยจุลินทรีย์ ในไต้หวันมีการวิจัยพัฒนาเอมไซม์เพื่อใช้หมักขยะอินทรีย์ลดเวลาจากแบบเดิม 3 เดือน เหลือเพียง 3 วัน