Профессию военного Борис Шапошников выбрал по необходимости. В семье было шестеро детей, и он, чтобы не обременять родителей, пошел в пехотное училище. А стал начальником Генерального штаба. 

В июне 1941 года назначен постоянным советником при Ставке Главного Командования Вооруженных Сил (ВС) СССР.

Участвовал в разработке контрнаступления Красной Армии зимой 1941-1942 гг.