瑩山紹瑾被邀請成為開山祖師，並被後醍醐天皇認定為曹洞宗出世道場。

曾與永平寺爭奪大本山地位，最終在1616年共同確認。

然而，遭受火災、遷址並重建，又遭受地震，不斷經歷重建。

現今的總持寺是一座現代化的禪寺，擁有教育機構，如鶴見大學及其他教育機構，

並且擁有七堂伽藍、威嚴的三門和宏偉的大祖堂。寺前可鳥瞰東京灣美景，吸引眾多遊客前來參觀、體驗坐禪。

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