La diferencia radica en que la publicidad de pago genera resultados inmediatos, aunque solo por el periodo de tiempo que dure la campaña (lo que hayas sido capaz de pagar)

Mientras que, de manera orgánica los resultados demoran en llegar, pero son más duraderos. No existe una alternativa mejor que otra. De hecho, lo ideal sería complementarlas o emplear cada una en el momento adecuado.