Emma oppdager en magisk klokke som tikkende lokker henne til den magiske verdenen, der hun får vite at tiden er i fare. Sammen med Gnist og Bamseblå reiser hun til Tidens Tre, hvor de finner spor som leder til en by i fortiden, nå fryst av en mørk kraft kalt Skyggen. Etter å ha funnet Tidskrystallen, kjemper Emma modig mot Skyggen og bruker klokken for å gjenopprette tidens balanse. Tiden begynner å flyte igjen, og Emma lærer at hun er en vokter av tiden og må være klar for å beskytte den mot fremtidige farer.