En la campaña de la toma de Lima, por parte del ejército de San Martín, una epidemia de malaria y paludismo, enfermó a gran parte del ejército patriota. Estos males aún hoy causan 200 millones de enfermos en el mundo, con aproximadamente 600 mil muertos al año.

Tras haber desembarcado en Pisco para la planificación de la batalla, San Martín recibió la invitación del nuevo virrey, solicitándole una entrevista con el objeto de conciliar y terminar las disputas entre “españoles americanos y españoles europeos”, como si se tratara de una guerra civil y no una guerra por la independencia. Esta reunión fue aceptada por San Martín y consumada el 9 de febrero de 1821, por delegados de ambas partes. La propuesta era la vigencia de la constitución de 1812 por la que americanos y europeos tendrían los mismos derechos. La iniciativa fue valorada por los delegados de San Martín, quienes indicaron que previamente era necesario el reconocimiento de la independencia del Perú. Esto fue rechazado y se suspendieron las conversaciones.