Hvis du er aktiv innenfor AI eller bioinformatikk har du sikkert fått med deg at det har skjedd et vitenskapelig gjennombrudd som forbløffer forskere verden over, og som den kjente biologen Andrei Lupas i den prestisjetunge vitenskapelige journalen Nature hevder: «will change everything». Proteinfolding har blitt sett på som et av århundrets største vitenskapelige utfordringer. Problemet kan oppsummeres: gitt en sekvens av DNA som koder for et protein, hvilken form vil proteinet få? 30. november ble det klart at  DeepMinds Alphafold 2 langt på vei har løst problemet.

I episode 2 har vi med oss Inge Jonassen, professor ved Universitetet i Bergen og leder av Computational Biology Unit. Inge er også leder for ELIXIR Norway, en europeisk infrastruktur for bioinformatikk. Inge jobber med AI og bioinformatikk, har selv jobbet aktivt med proteinfolding, og han har også vært med i CASP-konkurransen som AlphaFold 2 vant så overlegent.

I denne episoden snakker vi med Inge om hvordan kunstig intelligens har blitt brukt for å angripe proteinfolding og vi spekulerer i hvordan algoritmen AlphaFold 2 fungerer.