Karlheinz Zφller wurde 1960 Soloflφtist der Berliner Philharmonikern. 1968, nach einem schweren Autounfall, verlieί Zφller Berlin und wurde Professor an der Hochschule fόr Musik und Theater in Hamburg. 1976 kehrte er wieder als 1. Soloflφtist zu den Berlinern zurόck und blieb dort bis zu seinem Ruhestand.
Karlheinz Zφller war Solist in den Urauffόhrungen von Ligetis Doppelkonzert fόr Flφte, Oboe und Orchester, und der Flφtenkonzerte von Isang Yun und Manfred Trojahn.