El sistema integral de justicia fue creado en el Acuerdo de Paz para tratar los delitos que se habían producido durante el conflicto, con el objetivo principal de reparar a las víctimas. El sistema integral cuenta con mecanismos judiciales y extrajudiciales como la Comisión de la Verdad, la búsqueda de personas desaparecidas y la jurisdicción especial para La Paz - JEP.