Une modeste sépulture sur laquelle, cent ans après le martyre de l'Apôtre, un petit édicule funéraire fut construit, attesté par le presbytre Gaius à la fin du IIe siècle, comme le rapporte avec précision l'historien Eusèbe de Césarée (Histoire Ecclésiastique, 2, 25, 6-7). Cet édicule, généralement appelé "trophée de Gaius", indiquait aux premiers chrétiens la tombe de Pierre, qui, même avant Constantin, était la destination de pieux pèlerinages.