Արցախի դեմ սանձազերծված պատերազմում մեծ էր նաև սպիտակ բանակի մարտիկների առաքելությունը։ Հայկ Մարգարյանը մի քանի տարի առաջ է զորացրվել բանակից և կրկին ուսումը շարունակում է Մ.Հերացու անվան բժշկական համալսարանում։ Նա ևս հավատարիմ մնաց իր մարդկային ու մասնագիտական սկզբունքներին և պատերազմի առաջին օրերից մինչև ավարտը Արցախից վիրավոր զինծառայողներ դեպի ՀՀ տեղափոխող բժշկական խմբում էր` որպես կամավոր։