งูกับกิ้งก่ามีความสัมพันธ์ทางเครือญาติอย่างลึกซึ้ง ถือเป็นญาติสนิทกัน เพราะงูวิวัฒนาการมาจากกิ้งก่า ในยุคดึกดำบรรพ์นั้น งูถือเป็นหนึ่งในสมาชิกของวงศ์กิ้งก่ามาก่อน ซึ่งงูส่วนหนึ่งเมื่อผ่านวิวัฒนาการอันยาวนานมันจะปรับตัวเข้ากับสภาพแวดล้อมใหม่ ๆ ขาทั้งสี่ของมันหดหายไปกลายเป็นลักษณะเด่นอื่น ๆ แทน และแปรเปลี่ยนเป็นงูในที่สุด ซึ่งในอีกส่วนหนึ่งนั้นแม้จะไม่มีขาทั้งสี่แล้ว แต่เนื่องจากไม่มีคุณลักษณะพิเศษของงู มันจึงยังถือว่าอยู่ในวงศ์กิ้งก่าอยู่