The Wet Lab Coder

Hesaplamalı biyobilimci olmak ne demek? 🧬💻

The Wet Lab Coder’ın 2. sezonuna büyük bir soruyla başlıyoruz: Biyolojiyi anlamak için neden bilgisayarlara ihtiyaçduyuyoruz?

Hesaplamalı biyobilim tam olarak ne yapar ve bu alanda çalışmak isteyen birinin hangi bilgi ve becerilere sahip olması gerekir?

Bu bölümde hesaplamalı biyobilimin neden ortaya çıktığından, biyolojik problemlerin bilgisayarlarla nasıl ele alındığından ve bir hesaplamalı biyobilimci olmak için öğrenilmesi gereken temel alanlardan konuşuyoruz.

Biyoloji mi, programlama mı?
İkisini de bilmek zorunda mıyız?
Peki nereden başlamalı?

🎙️ The Wet Lab Coder — 2. Sezon, 1. Bölüm

#TheWetLabCoder #HesaplamalıBiyoloji #Biyoinformatik #ComputationalBiology #Bioinformatics #ComputationalBiologist #Biyoloji #Python #YapayZeka #MakineÖğrenmesi #BilimKariyeri

Nature’da rastladığım bir makaleden "Hücrenin Blasticidin hassasiyeti tam olarak ne demek?" sorusuyla başlayan bir moleküler yolculuğa çıkıyoruz.

Kısacası bu bölümde antibiyotiklere biraz farklı bir gözle bakıyoruz: Onlar sadece ilaç değil; hücreyi istediğimiz noktadan manipüle etmemizi sağlayan moleküler araçlar.

☕ Çayınızı/kahvenizi alın, laboratuvarın moleküler aksiyon filmine hoş geldiniz.

Bölüm de bahsettiğim makale linki;

https://www.nature.com/articles/s41586-026-10843-7#Sec8Bizi Instagram'dan takip edebilirsin;

https://www.instagram.com/the_wet_lab_coder/

Bilgisayar bir röntgene baktığında akciğer görmez.

Sayı görür.

Ben Sema Nur, bu bölümde o sayılardan teşhise nasıl gidildiğini konuşuyoruz: konvolüsyon, segmentasyon, transfer öğrenme ve asıl soru: model gerçekten öğreniyor mu, yoksa doğru cevaba giden kısayolu mu buldu?

podcastin videolu bölümü için: https://youtube.com/@twlc_snb?si=BccN872WNvR1rEAH

Bir tümör tedaviye yanıt veriyor, küçülüyor ve her şey yolunda görünüyor…

Ama milyonlarca hücrenin arasında kalan küçücük bir grup, ilaca dirençli olabilir.

Peki bu hücreleri, ortalamanın içinde kaybolmadan tek tek görebilir miyiz?

Bu bölümde Mualla, single-cell RNA sequencing teknolojisini anlatıyor.

Hücrelerin aynı DNA’yı taşımasına rağmen neden farklı davrandığını, RNA’nın bize hücrenin o anda ne yaptığını nasıl gösterdiğini ve “gen ifade profili” kavramını keşfediyoruz.

#TheWetLabCoder #SingleCell #scRNAseq #Biyoinformatik #Transkriptomik #YapayZeka #KanserAraştırmaları #HücreBiyolojisi #Biyoteknoloji

Kanser gerçekten genlerimizde mi yazılı? Meme kanseri gelişiminde genetik faktörlerin rolü nedir? Beslenme ve yaşam tarzı, genlerimizin çalışma şeklini etkileyebilir mi?

Merhaba ben Meryem, bu bölümde meme kanserinin genetik temellerini, BRCA genlerini, epigenetik mekanizmaları ve beslenmenin genom üzerindeki etkilerini bilimsel çalışmalar ışığında, herkesin anlayabileceği bir dille ele alıyorum.

Bölümde bahsettiğim ve yapay zeka destekli tanı sistemleri üzerine odaklanan kendi akademik çalışmamı da aşağıda paylaşıyorum. Daha detaylı bilgi edinmek isteyenler makaleye buradan ulaşabilir:

DeepScan: A Deep Learning-Based Clinical Decision Support System for Breast Cancer Diagnosis Using DenseNet121-CBAM and LLM Integration🔗 http://genediting.net?mod=makale_tr_ozet&makale_id=90457

Bu podcast yalnızca bilimsel bilgilendirme amacıyla hazırlanmıştır ve tıbbi tanı veya tedavi önerisi niteliği taşımaz.

İyi dinlemeler! 🎧

Yapay rahimler, laboratuvarda çalışan organlar ve dijital insan modelleri...

Bilim kurgu mu?

Yoksa geleceğin hastaneleri mi?

Şimdi seni 2050 yılından alıp 2026'ya getiriyorum.

Çünkü aslında bu hikaye henüz başlamadı.

Ve bugün konuşacağımız teknoloji, belki de o geleceğin ilkyapı taşlarından biri.

Bugün Mualla'nın sorusunu cevaplıyoruz.

Organ on a chip nedir, nasıl yapılır?

🧬 DNA bir sabit disk olabilir mi? Ya da sizin dijital bir kopyanız doktorunuzdan önce hastalığınızı teşhis edebilir mi?

Kulağa bilim kurgu gibi geliyor olabilir ama bu teknolojiler artık laboratuvarlarda geliştiriliyor.

Bu bölümde, geleceğin iki heyecan verici konusunu konuşuyoruz:

💾 DNA Veri Depolama – Verilerimizi neden DNA'ya yazmak istiyoruz? Bir gram DNA gerçekten milyonlarca sabit diskten daha fazla veri saklayabilir mi?

🫀 Digital Twin (Dijital İkiz) – Ya size özel oluşturulan dijital bir beden, hangi ilacın işe yarayacağını siz tedavi olmadan önce tahmin edebilseydi?

Peki tüm bu veriler nerede saklanacak?

Veriler gerçekten güvende mi?

Ve en önemlisi...

Kendi genetik bilgilerimizin sahibi gerçekten kim?

Bilimin sınırlarını zorlayan bu teknolojileri, avantajları, riskleri ve etik boyutlarıyla birlikte konuşuyoruz.

Kulaklığınızı takın ve geleceğin tıbbına bugünden kısa bir yolculuğa çıkın.

The Wet Lab Coder, bilimin geleceğine açılan SciPeak'in podcast kanalı.

Eğer geleceğin bugün nasıl yazıldığını merak ediyorsanız, doğru yerdesiniz. Çünkü her büyük keşif, bir merakla başlar.