Debianがソフトウェアを改変する理由は多岐にわたります。Debianポリシーに従い、/etcなどの標準的な場所に設定ファイルを配置したり、パッケージ間の連携のため、実行ファイル名やソケット場所などを調整します。また、プライバシー保護やセキュリティ上の理由から、外部への通信やパッケージシステムを迂回する更新を削除します。バグ修正を独自に行い、セキュリティ問題への対応も行います。Debian Free Software Guidelinesに準拠するため、非フリーな部分を削除したり、ドキュメントを追加したりすることもあります。