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リトリート: 合宿みたいな感じで遠くに行って発表・議論する内輪のイベント。タイル型ウィンドウマネージャスタック型ウィンドウマネージャi3wm: イシが使い始めたもの。Liu et al., 2021, Cell: 今回紹介した論文。Cellの表紙のサイサイ論文のプレビューisthmus: 地峡Isthmo-Colombian area「家系図のようなもの」: イシが家系図と言うのを避けているのはgenealogical ancestry(家系図上の祖先)とgenetic ancestry(遺伝子の祖先)の違いがあるからだったりする。Center for Evolutionary Hologenomics, GLOBE InstituteTom GilbertShanlin Liuクロサイ: Genome Arkにゲノムアセンブリが公開されている。シロサイジャワサイスマトラサイインドサイ(greater one-horned rhinoceros)ケブカサイ(woolly rhinoceros, 絶滅)Merck’s rhinoceros (絶滅)エラスモテリウム(Siberian unicorn, 絶滅)ABBA-BABA test:日本語の解説がない…元論文はDurand et al., 2011, Mol. Biol. Evol.。不完全遺伝子系統仕分け(incomplete lineage sorting)遺伝子流動(gene flow)Runs of homozygosityDemography: いわゆる人口統計というより、集団サイズの過去の変化を推定すること。同義置換 (silent/synonymous substitution)非同義置換 (non-synonymous substitution): Missense mutation (アミノ酸を変える1塩基置換) nonsense mutationと(終始コドンに変える1塩基置換)York et al., 2018, PNAS: ゲノム上のローカルな系統樹の形の割合をtopology weighting (Martin & Van Belleghem, 2017, Genetics)を使ってみている例。Editorial notes
実は足首捻挫した翌日で結構痛かった(イシ)音声で理解するのが過去一番難しいエピソードだったと思う(エビ)収録日: 2021.10.02編集: イシ
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