这篇文章介绍了一项针对501种癌症细胞系的大规模基因功能研究,旨在绘制
癌症依赖图谱。研究团队开发了名为
DEMETER的计算模型,有效区分了RNA干扰中的脱靶效应与真实靶向作用,从而识别出769个关键的
差异依赖基因。通过分析数万个分子特征,研究者利用
ATLANTIS回归模型成功预测了多项基因依赖性,发现
RNA表达水平是比DNA突变更核心的生物标志物。该图谱将这些依赖关系划分为
癌基因成瘾及
旁系同源缺失等四类,并通过实验证实了UBB与UBC基因之间的替代生存机制。这项工作为发现新型
治疗靶点和实现癌症精准医疗奠定了重要的分子基础。
References:
- Tsherniak A, Vazquez F, Montgomery P G, et al. Defining a cancer dependency map[J]. Cell, 2017, 170(3): 564-576. e16.