A Oração do Coração tem sua provável origem no deserto do Egito. Alguns dizeres de Evágrio Póntico aponta para isso:

"Esforça-te por manter teu intelecto surdo e mudo durante a oração, assim poderás orar."

Ela é fruto de um longo amadurecimento espiritual dentro do Cristianismo, especialmente a partir dos primeiros séculos. Ela se desenvolveu entre os padres do deserto e depois foi aprofundada pelo movimento do Hesicasmo.