Esta ermita fue originariamente la iglesia del Hospital de la Caridad que, al ser desamortizado en el siglo XIX, fue ocupado el edificio por dos escuelas nacionales. Entre los años 1748 y 1750 se llevó a cabo una importante remodelación, y fue entonces cuando se construyó la cúpula de la capilla mayor, obra realizada por el maestro cantero Mateo, natural de Trujillo. Fue restaurada en el año 1950, según consta en una inscripción por encima de la ventana del Altar Mayor.