分子系統樹は、生きものの形ではなく、DNAの塩基配列やたんぱく質のアミノ酸配列などをもとに分類・系統を推定したもの。
原核生物には、シアノバクテリア、納豆菌、大腸菌が含まれる。
古細菌アーキアには、超好熱菌、高度好塩菌、メタン菌が含まれる。
アーケプラスチダは、シアノバクテリアを取り込んで、体内で栄養を作れるようになったもの。陸上植物、緑藻、紅藻、など。
褐藻は、紅藻を取り込んで、体内で栄養を作れるようになったもの。
ミドリムシは、緑藻を取り込んで、体内で栄養を作れるようになったもの。
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