Fueron 50 los partidos que jugó Francisco Javier Elkoro en la Real Sociedad. Tuvo un debut tardío, pero llegó al primer equipo y podría haber jugado muchos encuentros más de no haberse producido una grave lesión en el partido que jugó el equipo txuri urdin frente al Atlético de Madrid en la temporada 1975-76. Fue en un choque fortuito y tras una recuperación extensa consiguió volver a jugar, aunque ya no fue el mismo.