Francisco Sein apenas pudo jugar 39 partidos con la camiseta de la Real Sociedad. Con solo 25 años, en enero de 1972 y siendo jugador txuri urdin, sufrió un accidente de tráfico en el puerto de Azpiroz y perdió la vida cuando su coche se precipitó por un barranco. Balaídos fue el último escenario que le vio jugar y la Real le tributó un homenaje en Atotxa ante el Valencia, el día que estaba prevista la entrega de la insignia de oro y brillantes a José Antonio Arzac, homenaje que se pospuso.