这项巨量分析（mega-analysis）系统性地整合了来自全球五个国家的11个独立数据集，旨在统一学术界对幻觉剂如何影响大脑功能的认知。通过对补骨脂碱、LSD、二甲基色胺、麦斯卡林和死藤水这五种药物的比较，研究人员发现这些物质能显著增强跨模态网络（如默认模式网络）与单模态感官网络之间的功能连接。研究利用贝叶斯层次模型量化了脑区互动的变化，并识别出壳核、尾状核及丘脑等皮层下区域在药效下的核心作用特征。该项工作通过统一的预处理流程，成功化解了以往单项研究中存在的实验结论矛盾。这一成果不仅为理解幻觉剂重构大规模大脑组织的机制提供了高置信度的概率图谱，也为未来精准医疗中的幻觉剂辅助治疗奠定了数据基础。

References:

• Girn M, Doss M K, Roseman L, et al. An international mega-analysis of psychedelic drug effects on brain circuit function[J]. Nature Medicine, 2026: 1-12.

这篇研究通过连接组建模，揭示了经颅磁刺激（TMS）治疗抑郁症的神经解剖学基础。研究发现，虽然刺激点背外侧前额叶（DLPFC）与下游目标膝下灰质（SGC）之间缺乏直接神经纤维，但信号可以通过包含丘脑和前扣带回等区域的多级多突触路径进行传递。通过分析两个独立患者队列的数据，研究者证实了这些白质通路的路径长度（跨越的神经纤维跳数）能有效预测临床疗效：路径越短、沟通越直接，患者的抑郁症状改善越明显。此外，研究还绘制出了介导治疗作用的皮质与皮质下回路，为优化磁刺激的精准定位策略提供了结构化依据。该成果表明，结合人类结构连接组的计算模型对于理解和提升脑刺激疗法的有效性具有重要价值。

References:

• Seguin C, Mansour L S, Betzel R F, et al. White matter pathways mediating dorsolateral prefrontal TMS therapy for depression[J]. Nature Neuroscience, 2026: 1-6.

这份研究通过对健康活体捐赠者进行空间转录组学和单细胞核测序，构建了首个人类肝脏空间基因表达图谱。研究发现，活体捐赠者的肝脏在基因表达上显著优于传统常用的死后捐赠或病灶旁组织，更能代表真实的健康基准。科学家揭示了人类肝脏特有的分区化特征，指出人类在代谢功能和免疫分布上与小鼠及其他哺乳动物存在重要差异。通过整合高分辨率影像与机器学习，该图谱还精准捕捉到了早期脂肪肝中肝细胞线粒体蛋白下降等动态病理变化。这一成果为理解肝脏生理功能及其在疾病早期的演变提供了关键的空间参考框架。

References:

• Yakubovsky O, Bahar Halpern K, Shir S, et al. A spatial atlas of the healthy human liver from live donors[J]. Nature, 2026: 1-10.

这份研究论文揭示了调控哺乳期雌性小鼠母性攻击行为的核心神经环路及其可塑性机制。研究人员发现，从后杏仁核（PA）到下丘脑腹侧中心（VMHvl）的特定神经通路对于启动和维持这种防御行为至关重要。在哺乳期间，该通路内的突触连接会显著增强，且VMHvlNpy2r神经元的内在兴奋性也会随之提高。此外，催产素（Oxytocin）作为一种关键的调节因子，通过作用于PA中的受体来增强回路输出，从而根据育种需求实时调整攻击强度。这些发现共同阐明了大脑如何通过结构与功能上的神经可塑性，确保母亲能够有效地保护幼崽。该研究还明确区分了介导攻击行为与交配行为的不同神经细胞亚群，从而揭示了社会行为控制的精确性。

References:

• Yamaguchi T, Yan R, Khan M, et al. The neural mechanisms supporting the rise and fall of maternal aggression[J]. Nature, 2026: 1-11.

该研究探讨了结直肠癌（CRC）早期演变中，癌细胞如何获得与转移相关的肿瘤胎儿可塑性。通过对早期T1阶段肿瘤的空间转录组学和单细胞测序分析，研究发现这些具有转移潜能的细胞状态在入侵发生之初便已普遍存在，而非晚期特有。类器官模型和全基因组测序证明，这种表型差异并非由细胞内部的基因突变驱动。相反，这种转变是由肿瘤微环境引导的，特别是位于入侵边缘的滋养细胞样癌症相关成纤维细胞（CAFs）诱导了癌细胞向胎儿态转化。此外，虽然这种可塑性是转移的必要条件，但最终的转移成功还取决于免疫逃逸等后续瓶颈。总之，这项工作强调了基质相互作用在决定结直肠癌早期恶化中的核心作用。

References:

• Buissant des Amorie J R, Hageman J H, Brunner S R, et al. Emergence of oncofetal plasticity is ubiquitous in early colorectal cancers[J]. Nature, 2026: 1-11.

这篇论文介绍了 Orthrus，一个基于 Mamba 架构的成熟 RNA 基础模型，旨在通过学习演化与功能特征来预测转录本的生物属性。该模型采用了对比学习预训练方法，通过最大化剪接异构体及跨物种同源序列之间的相似性，有效地捕捉了功能保守的基因组特征。研究表明，Orthrus 在预测 mRNA 半衰期、核糖体载量和亚细胞定位等任务中达到了顶尖水平。即便在标注数据极少的少样本场景下，它依然展现出卓越的性能，大幅领先于参数量更多的现有模型。此外，该模型能够通过潜在空间聚类区分不同异构体的功能差异，为理解复杂的 RNA 调控机制提供了强有力的计算工具。

References:

• Fradkin P, Shi R I, Dalal T, et al. Orthrus: toward evolutionary and functional RNA foundation models[J]. Nature Methods, 2026: 1-11.

这项研究通过单细胞转录组测序和空间转录组技术，系统地描绘了小鼠出生后小脑颗粒细胞的发育轨迹与空间分布。研究人员识别出颗粒细胞发育的四个关键阶段，包括两种祖细胞状态和两种分化状态，并明确了它们在小脑层级结构中的具体空间位置。此外，通过对比髓母细胞瘤样本，研究发现肿瘤细胞在转录特征上高度模拟了正常发育的颗粒细胞。然而，肿瘤中的祖细胞表现出明显的分化障碍和更强的自我更新能力，这种分化失衡直接关联到患者的不良预后。该成果为理解小脑发育机制及神经肿瘤的致病机理提供了重要的分子资源。

References:

• Luo W, Lin G N, Song W, et al. Single-cell spatial transcriptomic analysis reveals common and divergent features of developing postnatal granule cerebellar cells and medulloblastoma[J]. BMC biology, 2021, 19(1): 135.

这项研究揭示了神经元中膜相关周期性骨架（MPS）并非此前认为的稳定结构，而是具有动态重塑的特性。研究利用活细胞超分辨率成像技术发现，即使在无外部刺激的情况下，MPS 也会经历不断的局部拆解与重建。这种动态过程主要由钙离子信号驱动：钙离子流入激活了 PKC 激酶以解稳肌动蛋白环，同时激活了钙蛋白酶来降解分 spectrin 蛋白。此外，这种骨架的重塑受神经元活动的增强，并能有效促进轴突内的胞吞作用。该发现改写了人们对神经元细胞骨架稳定性的认知，强调了其在维持膜可塑性和信号调节中的关键作用。

References:

• Heller E, Kurup N, Zhuang X. The membrane skeleton is constitutively remodeled in neurons by calcium signaling[J]. Science, 2025, 389(6760): eadn6712.

该研究利用MERFISH成像技术，揭示了小鼠大脑中不同细胞类型在三维基因组结构与转录调控方面的显著差异。研究发现，细胞核的大小和染色质的物理包装与细胞的总体转录活性密切相关，神经元相较于非神经元细胞展现出更强的A/B区室隔离。局部染色质环境的改变直接影响细胞类型特异性基因及超级增强子的表达。此外，研究证实了MeCP2蛋白在维持染色质区室化中的关键作用。实验表明，MeCP2主要通过结合甲基化DNA（特别是mCAC），以核径向位置依赖的方式调节基因转录，这一发现为理解雷特综合征等神经发育障碍提供了重要的结构生物学视角。

References:

• Liu S, Wang C Y, Zheng P, et al. Cell type–specific 3D-genome organization and transcription regulation in the brain[J]. Science Advances, 2025, 11(9): eadv2067.

这项研究通过构建人类肿瘤图谱网络（HTAN）的一部分，利用多种单细胞、单细胞核测序以及空间表达技术，绘制了转移性乳腺癌的分子与细胞空间图谱。研究团队对来自60名患者的67份活检样本进行了深度分析，涵盖了9个不同的转移部位，旨在系统评估肿瘤微环境的复杂性。通过对比Slide-seq、MERFISH、ExSeq和CODEX等多种空间分析方法，该研究为不同技术在临床样本中的应用效能提供了重要参考。分析结果揭示了癌细胞表达模式具有极强的患者特异性，且这种特征在疾病演变和部位转移过程中保持相对稳定。此外，研究还识别了与免疫细胞浸润和上皮-间充质转化相关的空间表型，展示了这些多模态图谱在发现临床相关生物标志物方面的潜力。这一成果为理解转移性乳腺癌的细胞间相互作用及精准治疗方案的制定提供了数据支持。

References:

• Klughammer J, Abravanel D L, Segerstolpe Å, et al. A multi-modal single-cell and spatial expression map of metastatic breast cancer biopsies across clinicopathological features[J]. Nature Medicine, 2024, 30(11): 3236-3249.