🆕 Google Scholar - Community phylogenetics - 02.2021 (Part 1)


1. 通過系統發育比較方法揭示快速演化的線蟲在農業生境裡占主導地位 doi.org/10.1016/j.soilbio.2021.108183
Agricultural habitats are dominated by rapidly evolving nematodes revealed
through phylogenetic comparative methods

2. 爪子的系統發育信號顯示生態因子對加勒比海潮間帶節肢動物的影響 doi.org/10.1038/s41598-021-83747-3
Testing for phylogenetic signal in claws suggests great influence of ecology on
Caribbean intertidal arthropods (Acari, Oribatida)

3. 北美地表甲蟲形態性狀的相關性與系統發育信號 doi.org/10.1101/2021.02.12.431029
Strong trait correlation and phylogenetic signal in North American ground beetle
(Carabidae) morphology

4. 氣候變遷下新熱帶地區隱翅蟲多樣性與系統發育群落組成沿海拔的分布 doi.org/10.1111/ecog.05427
Diversity and phylogenetic community structure across elevation during climate
change in a family of hyperdiverse neotropical beetles (Staphylinidae)

5. 熱帶地區土地利用改變了甲蟲與鳥類基於性狀的群落構建規則 doi.org/10.1007/s00442-020-04829-z
Tropical land-use change alters trait-based community assembly rules for dung
beetles and birds

6. 瑞士阿爾卑斯山高海拔鳥類繁殖力及壽命的降低不受系統發育的影響 doi.org/10.1007/s10531-021-02127-5
High elevation bird communities in the Swiss Alps exhibit reduced fecundity and
lifespan independently of phylogenetic effects

7. 形態、系統發育與獵物的可獲取性對無尾類群落營養資源分化的影響 doi.org/10.1016/j.baae.2020.11.005
The effects of morphology, phylogeny and prey availability on trophic resource
partitioning in an anuran community

8. 物種的適應會降低競爭優勢並改變群落構建過程 doi.org/10.1098/rspb.2020.3133
Adaptation reduces competitive dominance and alters community assembly

9. 以嚴重受災的松樹岩地生態系統顯示系統發育尺度在達爾文歸化謎團中的角色 doi.org/10.1111/ddi.13220
The role of phylogenetic scale in Darwin's naturalization conundrum in the
critically imperilled pine rockland ecosystem


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演唱： Julia Wu 吳卓源, 陳芳語
編曲： terrytyelee
作曲： terrytyelee, Julia Wu 吳卓源, 陳芳語
製作： terrytyelee
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片頭與片尾：撥接 Instrumental
演唱： Julia Wu 吳卓源
編曲： terrytyelee 梁永泰
作曲： terrytyelee / Julia Wu 吳卓源
製作： terrytyelee / Tower da Funkmasta 陶逸群
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👉 功能性狀

👉 中性脂肪酸

👉 跳蟲演化

👉 系統發育保守性與系統發育信號



👨‍🍳🌱🍄🍔



天哪，這到底在說什麼？㊙️



文章來源： doi.org/10.1002/ece3.3472

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製作： terrytyelee

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片頭與片尾：

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Google Scholar - Community phylogenetics - 01.2021 (Part 3)

[4 土壤微生物生態 SOIL MICROBIAL ECOLOGY]
4-1 真菌α多樣性影響蘋果園土壤團聚體中細菌和真菌群落構建的隨機性 doi.org/10.1016/j.apsoil.2020.103878
Fungal alpha diversity influences stochasticity of bacterial and fungal community assemblies in soil aggregates in an apple orchard

4-2 真菌群落是枯木細菌群落組成重要的決定因素 doi.org/10.1128/mSystems.01017-20
Fungal communities are important determinants of bacterial community composition in deadwood

4-3 稻田土壤甲烷菌的共存模式與甲烷生成和群落構建密切關聯 doi.org/10.1186/s40168-020-00978-8
Coexistence patterns of soil methanogens are closely tied to methane generation and community assembly in rice paddies

4-4 擾動會持續抑制草地土壤微生物群落的隨機擴散過程 doi.org/10.1016/j.gecco.2021.e01452
Disturbances consistently restrain the role of random migration in grassland soil microbial community assembly


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背景音樂：
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演唱： Julia Wu 吳卓源
編曲： Julia Wu 吳卓源, terrytyelee, C-Infamous
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Google Scholar - Community phylogenetics - 01.2021 (Part 2)

[3 性狀方法與性狀演化 TRAIT APPROACHES and EVOLUTION]
3-1 基於性狀的群落間不相似性量測之文獻回顧與表現評估 doi.org/10.1101/2021.01.06.425560
Review and performance evaluation of trait-based between-community dissimilarity measures

3-2 基於性狀方法預測微生物入侵物種的群落構建與優勢程度 doi.org/10.1111/oik.07694
A trait‐based approach predicting community assembly and dominance of microbial invasive species

3-3 生長模式與系統發育關聯性對種子萌芽的影響：亞熱帶地區植物的大尺度分析 doi.org/10.1002/ece3.7132
Impacts of growth form and phylogenetic relatedness on seed germination: A large-scale analysis of a subtropical regional flora

3-4 蛇類家域範圍巨觀生態模式的親緣分析 doi.org/10.1007/s00442-020-04832-4
Phylogenetic analysis of macroecological patterns of home range area in snakes

3-5 高山草地植物物種性狀與物候的關聯 doi.org/10.1007/s00442-020-04846-y
Linkage between species traits and plant phenology in an alpine meadow


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Google Scholar - Community phylogenetics - 01.2021 (Part 1)

[1 多維生物多樣性 MULTI-FACETED BIODIVERSITY]
1-1 鳥類的物種、系統發育和功能多樣性對森林棲地破碎化的不同反應 doi.org/10.1038/s41598-020-76917-2
Different response of the taxonomic, phylogenetic and functional diversity of birds to forest fragmentation

1-2 城市棲地的破碎化導致開花植物的多樣性降低，並對蜜蜂生物多樣性產生連鎖反應 doi.org/10.1038/s41598-020-78736-x
Urban fragmentation leads to lower floral diversity, with knock-on impacts on bee biodiversity

1-3 物種與系統發育的組成顯示了酸性滲透濕地的植物群落對外來物種入侵具有抵抗力 doi.org/10.1186/s13717-020-00272-3
Taxonomic and phylogenetic composition show biotic resistance to exotic invasion in acid seep springs

1-4 生態系統復育過程介導的環境改變，改變了非目標類群的群落結構，但對於功能及系統發育多樣性則沒有影響：一個來自鹽鹼環境的實例 doi.org/10.1007/s10750-020-04494-6
Restoration-mediated alteration induces substantial structural changes, but negligible shifts in functional and phylogenetic diversity of a non-target community: a case study from a soda pan

1-5 環境條件、氣候因素和空間過程驅動著氣候異質的山區溪流大型無脊椎動物多面向的β多樣性 doi.org/10.1016/j.ecolind.2021.107407
The role of environmental conditions, climatic factors and spatial processes in driving multiple facets of stream macroinvertebrate beta diversity in a climatically heterogeneous mountain region

1-6 三角嵌合設計有效地顯示跨空間尺度生態的多樣性與過程 doi.org/10.1101/2021.01.15.426868
Fractal triads efficiently sample ecological diversity and processes across spatial scales

1-7 野生動物遺傳與系統發育多樣性的空間格局與保育 doi.org/10.1126/sciadv.abd5725
Spatial patterns and conservation of genetic and phylogenetic diversity of wildlife in China


[2 群落系統發育 COMMUNITY PHYLOGENETICS]
2-1 歐洲森林植被的系統發育結構 doi.org/10.1111/jbi.14046
Phylogenetic structure of European forest vegetation

2-2 熱帶大西洋森林的系統發育動態 doi.org/10.1007/s10682-020-10094-6
Phylogenetic dynamics of Tropical Atlantic Forests

2-3 蜻蛉目在伊朗中部極端環境中的群落系統發育β多樣性 doi.org/10.1007/s10841-020-00290-8
Phylogenetic beta diversity of Odonata assemblages in the extreme condition of Central Iran


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演唱： Julia Wu 吳卓源
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本集是EP3的Part 3，我們會繼續討論Thakur et al. 2020的這篇文章～

🐣🍡 ...耐心聽完還會有彩蛋哦～ ㊙️

👉 空間尺度的不同對我們進行土壤生物多樣性的研究時，會是個麻煩，還是是個幫助？
👉 如何設計一個「跨空間尺度」也同時能「跨不同類群」的實驗，來研究土壤生物的交互作用與擴散過程？

討論留言，請至
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👩‍🦰 高梅香  寧波大學 地理與空間信息技術系  教授
👧 姬俏俏  中國科學院 東北地理與農業生態研究所  博士生
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🎧 再次收聽：
👨‍🏫 EP1 [綜述] 全面了解土壤生物多樣性 ↓↓↓
open.firstory.me/story/ckjljkht4ie1c0893re8jydzl
🗣 EP3 [討論] Part 1 ↓↓↓
open.firstory.me/story/ckkbdwc07r1g60889m2g372ok
🗣 EP3 [討論] Part 2 ↓↓↓
open.firstory.me/story/ckkbdwsqmr6h00830q3jf1heh
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📑 文章來源：
Thakur et al. (2020) Towards an integrative understanding of soil biodiversity. Biological Reviews, 95: 350-364. doi.org/10.1111/brv.12567


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片頭與片尾音樂：
撥接 Instrumental
演唱： Julia Wu 吳卓源
編曲： terrytyelee 梁永泰
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咦？ 跳蟲是什麼「蟲」？ 牠們是跳蚤嗎？ 👀
跳蟲對環境和我們，有什麼幫助呢？

讓 🧔 安東・啵塔啵伕 (Anton Potapov) 寫給你看，我來說給你聽～ Ü

文章來源： doi.org/10.3389/frym.2020.545370
作者網頁： sites.google.com/view/antoncollembola/ (Anton Potapov)

跳蟲資源 ：
簡介與美照： www.chaosofdelight.org/collembola-springtails
臉書專屬頁： www.facebook.com/springtails
最詳細網站： www.collembola.org
最會跳的蟲： www.youtube.com/watch?v=Qu01EUeE5PM

任何想法歡迎留言與討論：
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背景音樂：
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演唱： Julia Wu 吳卓源
編曲： Julia Wu 吳卓源, terrytyelee, C-Infamous
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Chill
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編曲： terrytyelee
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Better
演唱： Julia Wu 吳卓源, 陳芳語
編曲： terrytyelee
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片頭與片尾：
撥接 Instrumental
演唱： Julia Wu 吳卓源
編曲： terrytyelee 梁永泰
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製作： terrytyelee / Tower da Funkmasta 陶逸群
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👥 EP3 [討論] - Thakur et al. (2020) - Towards an integrative understanding of soil biodiversity

🗣 Part 2
👉 是「擴散限制」，還是是「擴散」，才是群落構建裡的一個過程呢？
👉 這到底是一個「隨機性」的過程，還是是一個「確定性」的過程呢？

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文章來源： doi.org/10.1111/brv.12567
任何想法歡迎留言與討論： www.facebook.com/SoilBioDivPaper/posts/110275211027090

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👩‍🦰 高梅香 (Meixiang Gao) 寧波大學 地理與空間信息技術系 教授
(lhxy.nbu.edu.cn/info/1259/2693.htm; www.researchgate.net/profile/Meixiang_Gao)
👧‍ 姬俏俏 (Qiaoqiao Ji) 中國科學院 東北地理與農業生態研究所 博士生


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片頭與片尾音樂：
撥接 Instrumental
演唱： Julia Wu 吳卓源
編曲： terrytyelee 梁永泰
作曲： terrytyelee / Julia Wu 吳卓源
製作： terrytyelee / Tower da Funkmasta 陶逸群
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👥 EP3 [討論] - Thakur et al. (2020) - Towards an integrative understanding of soil biodiversity

這一集的節目中，我們邀請到了兩位科學家， 👩‍🦰 高梅香 和 👧‍ 姬俏俏，
和我們一起聊聊她們的研究，以及聽(讀)完Thakur et al. 這篇文章的感想～

🗣 Part 1
👉 她們當初是因為什麼樣的契機，開始土壤生態的研究呢？
👉 她們在從原本專業領域進入到土壤生態的過程中，有沒有遇到什麼困難？
👉 我們要如何理解土壤生物多樣性，為什麼要把土壤動物的體型分成「大、中、小」三種呢？

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👩‍🦰 高梅香 (Meixiang Gao) 寧波大學 地理與空間信息技術系 教授
(lhxy.nbu.edu.cn/info/1259/2693.htm; www.researchgate.net/profile/Meixiang_Gao)
👧 姬俏俏 (Qiaoqiao Ji) 中國科學院 東北地理與農業生態研究所 博士生

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文章來源： doi.org/10.1111/brv.12567
任何想法歡迎留言與討論： www.facebook.com/SoilBioDivPaper/posts/110275211027090


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片頭與片尾音樂：
撥接 Instrumental
演唱： Julia Wu 吳卓源
編曲： terrytyelee 梁永泰
作曲： terrytyelee / Julia Wu 吳卓源
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Google Scholar - Community phylogenetics - 12.2020 (Part 3)

[6 跨不同營養級的交互作用 MULTI-TROPHIC INTERACTIONS]
6-1 樹木的系統發育多樣性構成了多重營養層級上的群落 doi.org/10.1111/1365-2435.13722
Tree phylogenetic diversity structures multitrophic communities

6-2 植物的揮發物調控了植物和實蠅之間的演化交互作用，並且相較於非揮發性的防禦機制，揮發物在演化上更為不穩定
doi.org/10.1111/1365-2656.13414
Plant volatiles mediate evolutionary interactions between plants and tephritid
flies and are evolutionarily more labile than non‐volatile defenses


[7 巨觀生態學 MACROECOLOGY]
7-1 被子植物基於遙遠演化歷程的系統發育β多樣性在中國跨地理和生態空間下的分布格局 doi.org/10.1111/jbi.14036
Patterns of phylogenetic beta diversity measured at deep evolutionary histories
across geographical and ecological spaces for angiosperms in China

7-2 歐洲山毛櫸森林植物的物種和系統發育轉換隨著氣候的極端化而增加並取決於歷史因素 doi.org/10.1111/jvs.12977
Plant taxonomic and phylogenetic turnovers increase towards climatic extremes
and depend on historical factors in European beech forests

7-3 墨西哥南部瓦哈卡州倉鼠的物種和系統發育β多樣性 doi.org/10.1093/jmammal/gyaa128
Taxonomic and phylogenetic beta diversity of cricetid rodents in Oaxaca,
southern Mexico

7-4 棕櫚生活史性狀的演化速率在島嶼比在大陸要快 doi.org/10.1038/s41598-020-78267-5
Higher evolutionary rates in life-history traits in insular than in mainland
palms


[8 宿主與微生物關係 HOST-MICROBIOME ASSOCIATIONS]
8-1 生態和演化理論在不同系統中微生物群落動態中的應用 doi.org/10.1098/rspb.2020.2886
Application of ecological and evolutionary theory to microbiome community
dynamics across systems

8-2 宿主的形態複雜性影響了海洋微生物的多樣性 doi.org/10.1038/s41396-020-00856-z
Morphological complexity affects the diversity of marine microbiomes

8-3 季節變化及意外的環境干擾對自然棲息地中兩棲動物皮膚細菌的影響 doi.org/10.1093/femsec/fiaa248
Seasonal changes and the unexpected impact of environmental disturbance on skin
bacteria of individual amphibians in a natural habitat

8-4 華美奧鍬甲雄性與雌性個體間腸道細菌群落的差異 doi.org/10.3390/ani10122352
Divergence in gut bacterial community structure between male and female stag
beetles Odontolabis fallaciosa (Coleoptera, Lucanidae)


[9 R分析套件]
microeco：用來挖掘微生物群落生態數據的R package doi.org/10.1093/femsec/fiaa255
microeco: An R package for data mining in microbial community ecology

(完)


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