Johann Nepomuk Hummel se narodil 14. listopadu 1778 v Prešpurku, jak se tehdy nazývala dnešní Bratislava. Jeho otec, Johannes Hummel, byl v té době ředitelem Císařské vojenské hudební školy ve Vídni a dirigentem Schikanedrova divadelního orchestru v divadle Theater auf der Wieden. Jeho matka, Margarethe Sommer Hummelová, byla vdova po parukáři Josefu Ludwigovi. Jméno dostal malý Johann Nepomuk na počest českého světce Jana Nepomuckého.

Budoucí rakouský skladatel vystupoval jako zázračné dítěte už od útlého dětství. Nejprve byl žákem Franze Paula Riglera v Bratislavě. Ve věku osmi let se stal pak žákem Wolfganga Amadea Mozarta, který byl velmi překvapen chlapcovým nadáním a po dva roky mu poskytoval nejen výuku, ale i ubytování. Ve svých devíti letech Hummel vystoupil dokonce na jednom z Mozartových koncertů.