שיעור א' ובאי בית המדרש החדשים נכנסים בשנתם הראשונה לשיעור 'עולם הרוח' עם הרב נתן אופנר, ראש הישיבה, שמתקיים שלוש פעמים בשבוע. 'עולם הרוח' היא מערכה שנבנתה (ועודנה נבנית ומתחדשת בכל שנה ושנה) בידי הרב נתן, שמטרתה ליצור מבואות ויסודות בריאים ועצמאיים בדרכנו אל מפגש עם עולם רוחני. השיעור מאתגר הנחות יסוד לגבי מרכזיותם וחיוניותם של ממדי הרוח שבמציאות, ופותח פתחים לכניסה עמוקה וכנה לעולם רוחני שהוא מצד אחד חי, קיים ובלתי תלוי, ומצד שני חיוני וקיומי מתמיד.
מקורות השיעור רבים ומגוונים, ויונקים באופן רחב ועמוק משדרות התורה והרוח של עם ישראל לדורותיו, החל בספרי הראשונים, דרך ספרי המהר"ל, רמח"ל, גדולי החסידות והגר"א – וכלה בתורת הרב קוק זצ"ל.
לצד המערך של עולם הרוח, לימוד האמונה בישיבה נוכח ומשמעותי מאוד, והוא בא לידי ביטוי במגוון שיעורי אמונה נוספים שמועברים על ידי שאר הרמ"ים בישיבה, וכמובן בחברותות ובלימוד עצמאי.