Jag drömmer om Araukanien startar med Wayra Monasterios letande efter sig själv i relation till sitt andra land Chile och leder honom vidare in mot det chilenska urfolket Mapuche. Hans sökande för honom tillbaka till sin pappa och deras gemensamma arv. Där i, längst ner, finner han berättelsen om krigsgeneralen Lautaro.
Med avstamp i fem stora avgörande ögonblick i Lautaros liv följer Wayra och hans pappa Luis med honom på resan och fantiserar över hur en ensam och ung man kunde åstadkomma så mycket. Tillslut börjar Lautaros kamp säga något om dem själva och om vad det är Chile faktiskt har gått och fortfarande går igenom.