系统医学本质上是一种新的医学思维，它不是要取代目前主流的医学思维，而是弥补主流思维的不足。因为：疾病分为普遍性和个体性。好的治疗应该是个体化的，是一个逐渐逼近理想目标的过程，不能简单的化约成一次性的精准性的治疗。同时，人体具有康复自愈能力，所以治疗必须考虑保障这种能力的有效性，避免过度干预。医学是通过治病达到救人的艺术，缺乏科学的医学是愚昧的，缺乏人文的医学是冰冷的。