I dag byder Operaen på Dokøen velkommen til Inderhavnen, men i middelalderen udspiller sig helt andre scener her. Havnen er porten til verden, hvor mennesker, varer og skibe flyder til og fra, men den lægger også vand til voldsomme søslag og belejringer. I 1416 bliver København kongens by, og kampen om Østersøen er i fuld gang. Bølgerne går højt. Især de nordtyske handelsbyer er både fjende og ven, når slaget om handelen skal udkæmpes. Varer udveksles, som oftest bragt til byen med skibe, som den skude fra 1400-tallet, der er udstillet på Københavns Museum. Nye vinde tager handelen fra lokale til globale markeder i kølvandet på tidens opdagelsesrejsende. Skridt for skridt går byen fra at være købstad til at blive hovedstad.