David Baker(2024年タンパク質デザインでノーベル化学賞)ラボでポスドクをされています本田信吾さんをゲストにお呼びしました。本田さんはアサヒビールを経て東大野地研で学位を取られ、その後現在のBakerラボに所属されています。今回は本田さんのこれまでのキャリアからタンパク質デザインの現在、本田さんの現在の研究などについてお聞きしました。さらにBakerラボの雰囲気やシアトルの生活の様子など研究以外のトピックも盛りだくさんでお届けします。(収録日2025.01.18)

Shownotes:

野地研

本田さんの野地研での論文

デジタルバイオアッセイ

David R. Walt

Simoa (Degital ELISA)

Alkaline Phosphataseのheterogeneousな画分を検出して診断に応用

David Bakerラボ

プローブのデザイン

古賀先生　

David Agard

Top7

古賀先生のデザイン原則

NAISTの小林先生

VILYA

RoseTTAFold (Minkyung Baek et al.)

RFdiffusion

RoseTTAFold All-Atom

AlphaFold 3

Boltz-1

Deepmindがenzymologistを募集している

Serine hydrolasesのde novoデザイン

Florian Praetorius

Danny D. SahtoeとFlorianの論文

DynamicなHingeのデザイン

Adam Broermanの論文

AlphaProteo

BindCraft

Kejia Wuが設計していた

De novoデザインタンパク質で作られたCOVID-19ワクチン

分子デザインはじめました