米国シアトル・ボストン在住の神経科学者2人によるポッドキャスト。
最新の研究論文紹介や基礎科学・医学研究に関する(あるいは全く関係しない)雑談、留学情報など。
感想やコメント、質問などはtwitterハッシュタグ #NeuroRadio あるいはinfoあっとneuroradio.tokyoまで。... more
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NeuroRadio
By NeuroRadio
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FAQs about NeuroRadio:
How many episodes does NeuroRadio have?
The podcast currently has 79 episodes available.
NeuroRadio episodes:
September 15, 2024#79 The Wizard of Fz Broadの齋藤諒さん再登場。真核生物ゲノムにコードされたFanzorがRNAで標的をプログラム可能なエンドヌクレアーゼであることを示した論文、競合、ジョブハント、来年１月から理研で主宰予定のラボ運営方針について伺いました (8/31収録)
Show Notes (番組HP):
- 齋藤さん過去回 1 2
- 齋藤ラボ理研ECLページでの紹介
- 齋藤ラボ公募ページ（研究員・特別研究員）
- 齋藤ラボ公募ページ（パートタイマー・アルバイト）
- 理研 和光キャンパス 開拓研究本部
- トークしたイベント
- 濡木先生
- 西増先生
- 井上梓先生
- 古館昌平さんの回 1 2
論文パート
- Fanzor論文
- 最近のCell論文
- Feng Zhangラボ
- Cas9ゲノム編集論文
- Cas9ゲノム編集＠ヒト細胞 1 2
- Cas12
- Cas13
- Cas9祖先トランスポゾン論文
- Eugene Koonin
- OMEGA論文
- CASTホーミングについての齋藤さん前報
- 平野清一さんのIsrB構造論文
- ゲノム編集で病気も治るようになってきた
- トマトでGABAを増やす
- 魚で白身を増やす
- Jennifer Doudna達のFz論文
- IS (Insertion Sequence)：転移に最低限必要な酵素のみを内部にコードするトランスポゾンの一種。それぞれ番号がついていて、転移機構も色々。
- IS200/IS605
- IS607
- 2013年のFanzor命名論文
- AlphaFold
- Omar Abudayyeh（おまー）
- Jonathan Gootenberg（ぐーばー）
- 合同ラボ
- BioRxivのプレプリントHERMES
- Samuel Sternberg
- のHERMESイジり
- Science Advances論文
- TnpBのペーパー
- Virginijus Siksnys
- Kavli賞
- Soumya
- Han
- 毛みたいなほわっとしたカビ
- ATCC
- ツボカビSpizellomyces punctatus
- 濡木先生とSiksnysのTnpBの構造論文 1 2
- 末端配列とガイドRNA(ωRNA)配列の関係：これのc
- Spuのめっちゃ綺麗な末端配列：これのa
- ツボカビにも一応エレクトロポレーションはある
- PAM(Protospacer Adjacent Motif)：CRISPR-Casシステムにおいて、Cas9などのエフェクターがDNA切断を行う際に、標的配列の隣に必要とするモチーフ。SpCas9では3’側にNGG。
- TAM(Target-Adjacent Motif)：OMEGAシステムには“Protospacer”という概念が存在しないため、このように呼ぶ。
- TAM、トランスポゾン、ガイドとなっている：これのa
- Peel-and-paste：これのb
- Sam SternbergのSelfish Spreadの論文（機構はFig. 5g）
- 転写因子(TnpB様の転写抑制因子)の論文
- OMEGAのペーパーが出た時のNews and Views
- Robert Desimone
- RSIの成果報告会で受賞したのが公表されたページ
- CSHLのCRISPR Meeting
- HanのTnpBのペーパー
- CRISPR nuclease-protease
- 加藤一希先生
- Jonathan StreckerとEsraのCRISPR associated endopeptidase論文
- StreckerのCAST論文
- Peiyu Xu
- Guilhem Faure
- COVID-19で一緒に働いた
- Julia Joungの転写因子アトラス
- Max WilkinsonのR2論文
- R2レトロトランスポゾンのレビュー
- R2を使った挿入ツール 1 2
- David Liu
- David LiuのtwinPE
- Omar + Goober のPASTE
- PASTEを基盤技術にしたTome Bioscienceの最近の動向
- Jonathan Weissman
- Cas活性のパラメータについての仕事の一例
- 登さん
- Deliveryの話、例えばコレ
- 昔のラボメンはK99取ってた
- マイキーのPEG10
ジョブハントパート
- 小関先生
- 医科研のUTOPIA
- 早稲田にいた時の自分の指導教官
- UTOPIAについて一応調べた（100日でワクチン開発でした。。。 by齋藤）
- 東大の真下先生
- Cas3の論文
- 五神真先生
- 大阪大学の蛋白質研究所
- 定量研と卓越研究員制度
- 今年は加藤セチプログラムのみ
- Max君は本当にすごい
- Rockefellerインタビュー6人中2人がうちのラボ
- Kalli
- Helen Hay Whitney
- Hanna Gray
- Aviv Regev
- Xiaowei Zhuang
- Adam Cohen
- マイキーのラボ
- Max Wilkinsonの出身ラボ
- Kalliの出身ラボ
独立後の計画
- Joshua Weinstein
- DNA Microscopy
- Patrick Hsu
- Bridge RNA
- 宮脇さんが有識者の回
- 有識者会議
- 科研費倍増への運動
- 後藤由希子先生
- Kendall
- スイスで会ったギタリストの友達
- 本田圭佑
- HFSPミーティング
- 長田重一先生
- アポトーシスの写真
- 二階堂先生 ありがとうございました、引き続きよろしくお願いいたします！（by齋藤）
- 加藤英明先生 ありがとうございました、引き続きよろしくお願いいたします！（by齋藤）
- 奥山先生 ありがとうございました、引き続きよろしくお願いいたします！（by齋藤）
- Susan Gasser
- Patrick Matthias
- アセチル化やってた論文
- 吉田稔先生
- 古細菌テーマ＠HFSP
- 二段階になったHFSPフェローシップ申請（このReview Procedureタブを参照。Letters of IntentとFull Proposals）
- Yi Zhang
- 小嶋さん
- 寺坂さん
- 松田真弥さん
- 松本さん
- 古館さんのNature論文
- 長井淳さん 飲みましょう！！！（by齋藤）
- 齋藤さんMITのアドレス
Editorial Notes:
- 夢をみることができなければ、未来を変えることはできません。— 華麗なる一族（TBSテレビ, 原作・山崎豊子, 2007）（齋藤）
- 理研の現地インタビューも茶髪で乗り込んだのかどうか気になる (萩原)
- Shownotes大量に補足いただき大感謝です。今回もエナジェティックで非常に刺激を受けました、また是非！ (宮脇)
...more September 03, 2024#78 It's all mental 神経科学会と関連ソーシャル振り返り、Paperpileの運用、Figを作るためのソフトウェアについて雑談。後半は、任意の抗原をトリガーとして働くGPCR、“Placebo”による鎮痛を担うかもしれない神経回路について (9/1収録)
Show Notes (番組HP):
- 日本神経科学会奨励賞
- 一個下の後輩、村上さん
- 元ボス（大木先生、が授賞式に来ていた）
- 元ボス（アンドレアス、が裏枠でトークしていた）のシンポジウム
- Neuroscience Researchに出した論文
- 長谷川さんの前例
- Andrew Holmes
- 北沢さんとのシンポジウム
- 北村さん
- 尾藤先生
- Michael Greenberg
- のBrain Prize Lecture
- 後藤先生
- 五十嵐さんが言ってた回
- 今井さん
- が見つけてきたお店
- 長崎の平和会館
- 佐藤達雄さん
- Carandini
- 佐藤さん主催のサテライト企画
- Greg Stuart
- 安田さん
- Letzkus et al. 2011
- Kampa and Stuartの論文
- 田川さん
- 奥野さん
- 知覧特攻平和会館
- 虎に翼 NHKオンデマンドをAmazonプライム経由で観てます。(VPN必須) (萩)
- 日本初の女性裁判官、三淵嘉子さんについて
- 宮台真司先生 が悪いというわけではなく、ミサンドリー感情(+α)をフェミニズムと自称して活動する流れが問題なのであって、それを本来のフェミニズムと明確に区別して排除しよう、という意図での"クソフェミ"呼称であったという理解。 (萩)
- Jay Shendure
- NeuroTree
- George Churchのページ
- ボストンでもオーロラが見えた
- オーロラを観にこの温泉に行きたい (萩)
- Paperpile
- SigmaPlot
文献紹介パート：
- 文献１：Synthetic G protein-coupled receptors for programmable sensing and control of cell behavior
- Alice Ting
- Yulong Li
- KORD
- SPARK
- CAR-T
- SynNotch
- TRUPATHアッセイ
- TurboID
- 文献２：Neural circuit basis of placebo pain relief
- Grégory Scherrer
- 数年前のPainに関するミニスコープの仕事
- Analgesia: 鎮痛
- プラセボと治験についてのレビュー
- Fos TRAP初代 二代目
- von Frey試験含め疼痛評価法いろいろ (pdf)
- PnはCortexと小脳を繋ぐ重要な中継核
- Stress Induced Analgesiaはオピオイドが関与
- NPAS4 TRAPの論文
- Spontaneous ActivityによるHebbian Plasticity
- EmillianiのScanlessでオプシン型GEVIでも2p イメージング
- Adam Cohenの方
- MECのLeft-right-alternating theta sweeps
- LECのイベントストラクチャー表象
Editorial Notes:
- 朝ドラ、ちなみにリーガルハイの2期を観ていた人には要注意。岡田将生が近しい文脈で全く違うキャラで出現するので混乱します。(萩原)
- 掛け算ができない…小学生からやり直します。Pontine Nuclei, 麻酔賭けた時にこの領域が活動しているのかちょっと気になります (宮脇)
...more July 19, 2024#77 Timestamping academic life events onto podcast sequels – Part 3 定期ゲスト、デンマーク・オーフスの北沢太郎さん(@kitazawa_taro )。Neuro2024での記憶シンポジウムの宣伝、ラボ立ち上げから2年での進捗、初FENS参加など (7/11 収録)
Show Notes:
北沢さんラボ
Neuro2024のシンポ (2S06a, 7/25 木曜日 16:00-18:00, 第6会場)
Yingxhi Lin (“UTさうすうえすたん”ね。”てきさすさうすたん”てなんや...)
北村貴司さん
北西祐貴さん (後藤研メンバー)
Michael Greenberg御大
ERC
さきがけ (PRESTO)
LinのBiorxiv
Lin のNpas4 Cell 2020 論文
Sheena Josselyn / Paul Frankland
Sadegh Nabavi
伊藤夏穂さんのポスターは初日 (7 月24日午前 1P-179)
DANDRITE Scientific Advisory Board (SAB) Meeting
Greenbergの2014 (Malik et al.)
Seattle Hub for Synthetic Biology
Jay Shendureの論文(Choi et al., 2022)
Jesse Gray この人もGreenberg系列。一瞬独立してKCl-IEG実験(Tyssowski2018)とかやってたが気づけばなぜかAllenにいる。
Chao Sun
エリンシューマン
Anna Klawonn
米原さん
フィリッポ
オーフス大学
BGI
Greenberg Fos engram 論文 1, 2
Fens Kavli Network of Excellence
Ryohei Yasuda
Peter Scheiffele
Yang Dan
Ole Kiehn
FENS2024 ウィーン
Alice Ting
Brain Conference
古館さん
いまスペインに旅行いくと水かけられる Barcelona anti-tourism protesters fire water pistols at visitors (CNN)
FENS2026はMadridらしい
池の平ホテル
Editorial Notes
「白樺リゾ～ト～池の平ホテル♪」のCMでおなじみの池の平ホテル、実家のわりと近くですが行くのは初めて。涼みながらデスクワーク出来そう (北沢)
シンポジウム盛会を祈念しております！しかし2年でこんなに進んでるの流石すぎます(脇)
福岡でお会いしましょう。「NR聴いてます」ではなくて「論文読みました」(隠語)といって声かけてください(萩)
...more July 14, 2024#76 Getting Out of the Comfort Zone UC Irvineの五十嵐啓さん(@kei_m_igarashi)再登場。転職活動振り返り、次に出る論文のSneak peek (詳細はNeuro2024のセッションにて)、R01グラント審査の実際＆それを踏まえた書き方戦略講座、若い人へのメッセージなど (7/6 収録)
Show Notes (番組HP):
- 五十嵐さんラボ
- 五十嵐さん回 1 2,3 4
- Richard Tsien
- Paul Glimcher Neuroeconomicsの教科書に結構影響をうけたので残念...(萩)
- Nicolas Tritsch
- この前Nature出てた
- 坂野先生
- 2020と2021に出た論文
- 尾藤先生＠Committee Chair
- Hannah Monyer
- 北村さん
- 最初の大学院生がPhDを取った
- Heechul Jun
- Jason Lee
- 横山先生(pdf)
- 山本先生
- 吉田豊さん
- 内田さん
- 加野真一さん
- 森下博文さん
- Attila Losonczy
- Hard money vs Soft money (pdf)
- ノルウェーのボス
- 学士院の賞
- 訴訟に関する記事 訂正：BrandeisではなくTufts
- 井上夫妻回 1 2 3 4
- 千歳さん回
- 五十嵐さんのジョブハントメモ
- Bonhoefferの論文
- Earl Miller
- 五十嵐さん達のNeuro2024でのセッション
- Rbp4-creなどについてのGENSAT論文
- MECからのPerforant PathをLesionするとCA1のPlace Cell場所受容野が曖昧になる ※ただしGrid Cell阻害実験の解釈は分かれている？：Leutgebのこの辺りの論文 1 2
- 海馬からの興奮性入力がGrid cellの発火パターン形成に必要
- 伊藤さん
- のNucleus Reuniensの仕事
- MECの恐怖記憶への関与を調べた北村さんの仕事 その続報 prefrontalの関与
- Hongjun Song
- 藤澤さん
- Antonio Fernandez-Ruiz
- Noah Gray
- ASCONA meeting
- Robert Datta
- Shohei Furutachiさん回 1 2
- Lake Conferences
- Gordon の Basal Ganglia
- 彦坂先生
- 金子先生
- 松田先生
- のJN
- 柳下先生
- 北欧のドーパミン学会IBAGS
- Dayan
- Gordon の Frontal Cortex
- Bruce McNaughton
- 40 Hzの話
- アナベル
- Li-Huei Tsai
- Buzsakiが出したああいう論文
- Gordon のNeurobiology of Cognition
- Desimone
- 宮下先生
- Brain Initiative 40 % カット
- NIA
- NIMH
- Early Stage Investigator (ESI) Policies
- LMDNのスタディセクション
- NIH RePORTER
- 小宮山先生
- CDIN
- NSF
- Lake ConferenceのDisease focusedな回
- Menno Witter
- Ted Jones
- 安田先生のブログポスト
- NIHのeRA commons
- 参考：R01で査読者から貰うサマリーステートメントの例 (某ラボの公開gdocs)
- 参考：R01アプリケーションのサンプル (pdf)
- PO: Program Officer
- U01
- P
- Ivan Soltesz
- Gary Lynch
- 海軍のグラントOffice of Naval Research
- 神経科学の達人での講演
- 薬理行動薬理若手研究者の集いでの講演
- 本庶先生の私の履歴書
- 羊土社の留学対談その１ その２
- 日本学生支援機構の海外留学支援制度
Editorial Notes:
- 前回話させてもらったのがついこの前のように感じるのですが、3年も経ったとは。月日が過ぎるのはあっという間ですね。宮脇さん萩原さん、NeuroRadio三年間お疲れさまでした。研究者というのは楽しくも、つらく苦しい人生だと思っていましたが、テニュアがもらえると心の安寧が得られ、見える景色がだいぶ変わってきます。でも、人生で一番ダイナミックだったのは大学院生・ポスドク時だったのも事実です。みなさん、今を頑張ってください！Carpe Diem!! (五十嵐)
- 非公開アフタートークも楽しかったです、五十嵐さんありがとうございました！(脇)
- カレルは「俺は人生で一度もテニュア持ったことないぞ」っていつも偉そうに言ってます(萩)
...more July 02, 2024#75 Dreaming of dreams Northwestern Universityで来年1月から独立する千歳雄大さん(@yutasenzai)さんがゲスト。BuzsakiラボでのPhD、Scanzianiラボでのポスドク、ジョブハントで苦労したこと、独立後の研究計画について伺いました (6/20 収録)
Show Notes (完全版)：
- 千歳さんラボHP
- Scanziani lab
- Buzsaki lab
- 千歳さんに部屋を貸してもらった回
- 河野憲二先生
- 小川正先生
- 成宮周先生
- 古屋敷智之先生
- Michela Gallagher
- Denis Pare
- ユーリ: ブザキのこと
- 藤澤先生
- 水関先生
- Eran Stark
- OLM cell specificなCreライン
- PhD時代の論文その１：Mossy Cellの論文
- DRD2-creでMossyがラベルできる、の論文
- POMC-creでGCラベル、の論文
- NeuroNexusのBuzsaki シリーズを含むカタログ(pdf)
- 電気生理的な特徴でGranuleを分離する、の論文 ”To our knowledge there are no electrophysiological characteristics with conclusively identify a neuron as a granule cell. In conclusion, it will be necessary in future work to use mode refined neurophysiological criteria combined with anatomical marking techniques for classification of dentate units.”
- B2B2BになったLosonczyの論文とKnierimの論文
- PhD時代の論文その２：V1で層の特徴量を見つけた論文
- Antonio Fernandez-Ruiz
- Shawn Olsenの論文
- ポスドクでの仕事
- SC-postrhinalを調べた論文
- Mu-ming PooとYang DanのActivity recall論文
- Adrien Peyrache
- の、REM睡眠中Head Directionシステム論文
- Robert Wurtz
- による、サッケードを生み出す回路のレビュー
- Roger Nicoll
- Pontine waveとREM
- Gilles Laurent
- Reptileにおけるmidbrainのinterhemispheric competitionへの関与
- 井上夫妻のZoomミーティングに関するアドバイスの回 およびノート
- Feinberg School of Medicine
- 2pImagingは結構decodingできる (from 大木研)
- 西本さん
- 神谷さん
- 睡眠中のGrid cellとHDとのcoordination
Editorial Notes:
- 今回はこのような機会を頂き大変ありがとうございます。僕自身、大変楽しませて頂きましたし、これまでのことやこれからのことを考え直すいい機会にもなりました。Northwestern大学で来年1月からLaunchする研究室では、一緒にサイエンスを楽しんでくださるポスドク、学生、ラボテクを絶賛募集中ですので、興味があればいつでもご連絡ください！（千歳）
- 日常会話で海馬の豆知識を出せるようになりたい (脇)
- なんでデニパレさんのとこには行かなかったのかをきくのを忘れました (萩原)
...more April 29, 2024#74 Letters to the editor TED風トーク、DIY引っ越し、ライティングとLLM、買って良かった某アイテムについて雑談。後半は初のおたより回 (4/18収録)
Show Notes (番組HP):
雑談パート
- Doudna
- TEDに出た
- 神経科学学会にDoudnaが来た
- U-Haul
- DeepL Write
- 2021のIntercalated cluster論文
- ChatGPT
- Claude
- Nature系列がやってる校閲サービス
- Paperpile
- Tushy
- Totoの携帯用Washlet
- シュピューラー
おたより紹介パート
- 押尾学
- 重要度と緊急度のマトリックス
- ビジネス書
- 論文は常に書いていくもの、の出典
- を書いたGeorge Whiteside
- 岡本太郎的な
- Trachtenberg
- ScanzianiがNeuronに出した
- Yang DanからNature
- Mriganka SurからNature
- 加藤さん回
- のChR構造論文
- 佐野さん回
- あやかさん回
- 研エン
- 神谷先生
- 発火頻度のログノーマル分布
- Alison Barthのやつ
- Toroidal回
- GEVI回
- Kilosort4論文
- 牧野さん回
- サットン本
- 藤島さん回
- 麻しんワクチン接種について（Q７）
- ロジスティック曲線ではなくロジスティック写像でした
Editorial Notets:
- 優しいおたよりばかりでホッととしました (脇)
- 健康のために12月にあるハーフマラソンにエントリーしました。スキーシーズンinしたときには既にいいコンディションという利点も。というわけで有酸素もやります。(萩)
...more March 26, 2024#73 The yellow light for RdLight 健康診断、３年めのタックスリターン、グリーンカード取得、万年筆と競技ペン回しについて雑談。文献紹介は、RNAで認識部位をプログラム可能なリコンビナーゼ、プローブのPhotoswitchingによるアーティファクト、軸索ミトコンドリアはATPを消費する、のプレプリント (3/10収録)
Show Notes (番組HP):
- たち：白子 (英語メニューだとSoft Roeって書いてあってFish Spermじゃないんだな、と思うなど)
- コメント募集！のGoogle Form
- Querie.me
- 3年めのJ1ポスドクのタックスリターン
- IRSのExemption 記述その１ vs 記述その２
- SPRINTAX ReturnsとCalculus
- 税金計算ソフトのチャットボット間違えまくり、の記事
- 7000ドル追加徴税の回
- 日米租税条約第２０条廃止について：1,2年めも米国源泉所得がある場合は徴税対象っぽい？
- JHUがまとめたフェローシップリスト
- NIHグラントのEligibility
- USCIS: 米国市民権・移民業務局のこと
- Jetstreamの芯が国際規格に ６年前でした
- 宮脇が使っているLAMY の万年筆
- Faber‐CastellのE-Motion all black
- 萩原さんが想定していたLAMYの万年筆 (サファリ)
- ゲルト・ミュラーがデザインしたBraun sixtant SM 31とLAMY 2000
- ペン回しの技一覧
- さらさら系のJetstream対抗馬はゼブラのサラサでした。
- ぺんてるのシャープレット クリップを取り外せるのはシャープレット"2"でした。
文献紹介パート
- 一報目：Bridge RNAs direct modular and programmable recombination of target and donor DNA
- Arc Institute
- Patrick Hsu
- Silvana Konermann
- 西増先生
- マイクロスケール熱泳動
- Evo
- 二報目：Comment on ‘Accumbens cholinergic interneurons dynamically promote dopamine release and enable motivation’
- Nicolas Tritsch
- Mohebi et al のAccumbens cholinergic interneurons dynamically promote dopamine release and enable motivation
- Frenemy
- Bernardo Sabatini とTritschのb2b nature
- Dana et al.,のjRCaMP1a, bとjRGECO1a Fig2-Supple3,4がPhoto-switchingのFig
- Erratum (出版社側のミスの訂正)というよりはCorrigendum(著者側のミスの訂正)でした
- SchultzのRPE
- メンデル捏造？に関する議論のまとめ
- 赤色dLight
- Mohebi & Berke のNature論文
- Azcorra et al., Awatramani と Dombeckの論文
- 内田さんの論文
- 最近Stephan Lammelが出したNature Neuroの論文
- 一人で訂正これでこれを訂正したと思っていましたが、
- 自己訂正というよりかは、StuberとDAT-Cre vs Th-Cre でやり合っていた感じでした
- Voltage IndicatorのPhotoswitch
- IRを一緒に当てると褪色が遅くなる
- Kaede
- CAMPARI
- X-CAMP R
- RCaMP3 Nature Methodsに掲載 (3/21)
- 初代mScarlet
- Kaesarのドパミン軸索でのaction potential initiation by Cholinergic input
- Stephanie Cragg
- 三報目：Most axonal mitochondria in cortical pyramidal neurons lack mitochondrial DNA and consume ATP
- 平林先生
- Bio-stationさんのポッドキャスト
- Franck Polleuxラボ
- 田尾さんのミトコンドリア局在と軸索分岐の論文
- もう一報出てたやつ：Polleuxラボからでした
- 本来のScanning Ion Conductance Microscopy
- SypHer
- iATPSnFR
Editorial Notes:
- ボストン唯一の万年筆専門店がつい最近閉業したらしい。惜しい (脇)
- 引越し全部自分でやったので結構大変でしたが無事終わりました。まだ新居全然片付いてないですが、広くなって嬉しいです。万年筆を眼球に..はジョジョ3部ですが誰にも伝わってなさそう(萩)
...more February 20, 2024#72 Collaborative professionalism in neuroscience 北京脳科学研究所の大久保達夫さんゲスト回。工学部からシステム神経科学に進んだきっかけ、FeeラボPhD時代、WilsonラボPD時代、現在のデータ解析を中心とした働き方の狙い、専門の分業に関するディスカッション、等 (12/30 収録)
Show Notes (完全版):
- 大久保さん個人HP
- 吉良さん@Chris Harvey Lab
- 計数工学科
- Michael Fee lab
- FeeラボでのNature論文
- の日本語版解説
- FeeラボでのNeuron論文
- の日本語版解説
- Rachel Wilson lab
- Neuron論文
- Pattern RecognitionとMachine Learning (PRML)
- パターン認識の教科書の表紙
- Parallel Distributed Processing (PDP): 並列分散処理で認知機能を説明しようとする1980年代に流行ったUCSDを中心とする認知科学のグループ。
- Paul Churchland の本The Engine of Reason, the Seat of the Soul
- Patricia Churchland
- Mark Churchland
- Anne Churchland
- Terrence Sejnowski
- The Computational Brain
- Dmitriy AronovのScience論文（HVC破壊してもSubsongは残る）
- COSYNE
- Temperatureのやつ
- 鳥の歌生成に関わる脳領域、RA、HVC、LMAN の関連など
- Jesse GoldbergのDopamineがPerformance errorをコードしている論文
- 親の歌を聴かせなかった時のHVCのシーケンス活動
- Galen達がミニスコープを作ってカルシウムイメージングを始める
- Genetic Dissectionのレビュー論文 2008
- Andreas Luthiと David Anderson のb2b 2010
- ハエはニューロンが個体を越えてIdentifiable: 仕事としては逃避を司るgiant fiber interneuronというのが古くから知られていて一番有名ですが、このニューロンは巨大なので例外で、ほとんどのタイプはsplit-Gal4のラインが整備されて以降（ここ10年）解析できるようなってきました。以下の仕事が代表的な例として挙げられます。
- 麻生さんのキノコ体の神経解剖、光遺伝学の仕事
- 並木さんの下降性ニューロンの仕事
- 実際split-Gal4作りがうまくいくと（２つのGal4ラインのうまい組み合わせが見つかると）、麻生さんの論文のFig. 2のように左右に一つずつあるニューロンが綺麗に取れてきます。一旦split-Gal4ラインができてしまえば、GFPを発現させてパッチしたり、オプトで活動を操作したりと、単一ニューロンレベルで解析できるのが良いところです。もちろん一つのセルタイプに複数のニューロンがあることもあるので、その場合は同じセルタイプ内では区別はできませんが（大久保）
- ちなみにこのビデオがhemibrainというEMのデータから再構築されたニューロンのギャラリーで、一個のcell typeに名前がついていて、ユニークな形をしているのが分かりやすいと思います。このユニークな形のおかげで、EMのデータとsplit-Gal4を作る際に撮った光学顕微鏡のデータのマッチングは非常にうまくいっていて、同じニューロンを両方のデータで見つけられます（大久保）
- 髭さんのキノコ体の電気生理の仕事
- 並木さんの下降性ニューロンの仕事
- ハエのConnectome論文 Central Brain Whole Brain
- 大学院生がやった行動実験の仕事（嗅覚と風を検知する機械受容覚にコンフリクトがあった場合、機械受容覚に従う）
- Vivek Jarayaman
- の仕事
- ハエDual Patch, 隣の大学院生がやった運動に関するニューロンのdual patchの仕事
- ハエのTriple Patch: このWilson研の大学院生の仕事のFig. 4ではシナプス結合している３つのニューロンからのin vivo同時記録という超絶技巧あり！
- Janeliaがハエのラインをリリースした（Split-Gal4）
- 風間さん
- Wade Regehr
- Bernardo Sabatini
- Chris Harvey
- Michael Greenberg
- 北京脳科学研究所の組織図
- メンフクロウの音源定位のレビュー この頃のScientific Americanは分野の第一人者が平易な文と分かりやすい図でレビューを書いており、素晴らしいです。
- 鳥と哺乳類で音源定位の神経回路は似ているか？
- 小西正一先生のobituary
- Matt Wilson
- Josh (Siegle)
- CIBRでのPI公募
- The Transmitterの神経科学における専業に関するオピニオン記事
- Jakob Voigts
- Open Ephys
- DeepLabCut (DLC)
- Advanced Technology Team
- Image Analysis Collaboratory @ HMS
- Institutional Knowledge
- Instrumentation Core @ HMS
- 北京脳科学研究所のInstrumentation Core
- AquiNeuro
- Cyril Herry
- Fixstars
- OpenScope
- Jérôme Lecoq
- Mark Schinitzer
- 異なる個体においてもニューロンの集団活動のダイナミクスが似ている
- Segment Anything (Zero-shotで画像のセグメンテーションを行うモデルの例）
- DeeperCut
Editorial Notes
- この度は貴重な機会を頂き、有難うございました！過去のNeuroRadioのゲストの方の中には一緒に語り合った仲間も多く、こういった形で近況アップデートできて良かったです。自分は、様々なタイプの科学者のちょっとした出来事に垣間見られる「現場でのプロフェッショナリズム」に大きく影響を受けてきました。そういった学会発表や論文からはなかなか見ることのできない科学者の人物像に関するエピソードを盛り込むようにしましたが、少しでも雰囲気が伝われば幸いです。後半の神経科学におけるコラボレーションの議論では、Allen InstituteやWyss Instituteでの様子も聞けて、色々と参考になりました。 (大久保)
- 自分もなるべく生データに近い所で働きたいです。新しい研究所で新しいキャリアの在り方を作るのは大変そうですがハマれば理想的ですね (宮脇)
- 生理実験がまあまあ得意、というのに要所要所で支えられてきましたが、実験はできるだけ早く引退したい…(とはいえ解析だけで生きていけるほど解析能力が高くないのであった) (萩原)
...more January 18, 2024#71 My Favorite Things 2023 新年のんびり雑談回。去年の振り返りと今年の抱負、おたより回は実現可能なのか。後半は2023年お気に入りアルバム10選、お気に入りYouTubeチャンネル5選。(1/11収録)
Show Notes (番組HP):
- 震災関連の寄付窓口まとめ
- 最近のエピソード
- 〇〇を救いたい
- NeuroRadioへのお便りフォーム
- Querie Tips
- 研エンさん
- の、おたよりフォーム
- Overleaf
- DiscoverabilityとEnforceabilityについて言及した記事
- Science Advancesにのったやつ
- について扱ったNeuroRadio回
- ニコラス就職
- K99/R00
- 去年の年始回
2023年宮脇お気に入りアルバム 10選
- Favorite Album 2023まとめツイート
- Sufjan StevensのJavelin
- Illinois Apple Music Spotify
- Call Me By Your Nameで使われてた歌
- ギランバレーになった
- 10: Deena Abdelwahed - Flagranti (EP)
- Flirt
- Heba Kadry
- YMOのAbsolute Ego Dance
- Jbal Rrsas
- 9: Ricardo Dias Gomes - Muito Sol
- Menos
- Joao Gilberto
- Stan Getz
- Nara Leao
- 8: Laurel Halo – Atlas Apple Music Spotify
- Late Night Drive
- Hyperdub
- Lucy Railton
- James Underwood
- Ryoji Ikeda
- Alva Noto
- 7: Headache - The Head Hurts but the Heart Knows the Truth
- Bucket Listener
- Vegyn
- Frank OceanのBlonde
- Blonded Radio
- PLZ Make It Ruins
- 6: Model/Actriz – Dogsbody
- Amaranth
- Steve AlbiniのBig Black
- Rapeman
- Shellac
- Arca
- 5: Sanam - Aykathani Malakon
- Bell
- CAN
- Faust
- 4: Ali Sethi & Nicolas Jaar – Intiha
- Muddat
- Nicolas JaarのTelas Apple Music Spotify
- Ziggy Stardust Apple Music Spotify
- 3: Goat - Joy in Fear
- プロモ映像
- Kraftwerk Man-Machine Apple Music Spotify
- Weired Fishes / Arpeggi
- boomkat
- KakuhanのMetal Zone Apple Music Spotify
- 2: Titanic – Vidrio
- Anonima
- Mabe Frattiの作品
- ラジオのように
- Life Without Buildings
- 1: Bendick Giske – Bendick Giske AppleMusic Spotify
- Rush
- Beatrice Dillon
- Steve ReichのIt’s gonna Rain
- Pharaoh Sanders
- Albert Ayler
- その後につづいたシングル 曲も良いですが “See on both sides like Chanel” が秀逸すぎてハマりました
- Dissect podcastのBlondeに関するシリーズ
2023年萩原おすすめYouTube 5選
- 1: パワーチューブ
- おすすめ動画: 2023年最新！ベンチプレスの【基本】はこれで分かる！日本王者解説！
- 牛山選手
- SBD
- が主宰するシェフィールド
- 2: Jeff Nipperd
- おすすめ動画：How To Train Like A Minimalist (More Gains In Less Time)
- Broscience
- Progressive Overload
- 今古賀翔
- 走ることについて語るときに僕の語ること
- 3: 散財小説ドリキン
- おすすめ動画：「本日最終日！ゼンハイザー e935 vs e945 vs Shure MV7 仁義なきサイドバイサイド比較」第2086話
- おしりが洗えるシャワー
- を取り上げたNR回
- U87Ai, SM7B, Beta58A, EarPods
- Rebuild.fmどりきんさん回まとめ
- 4: ReHacQ−リハック−
- おすすめ動画：【最先端！快眠の科学】Google賞金4.5億！天才睡眠学者が登場【常識覆す研究】
- 日経テレ東大学
- 菅前総理回
- 国民民主党の党首回
- 新NISA回
- 山崎元氏による新NISA解説
- 5: 小倉知巳のイタリアンプロ養成講座
- おすすめ動画：ミシュラン1つ星イタリアン店の「スパゲティ・カルボナーラ」【#イタリアンプロ養成講座 vol.8】
- Regalo
- 落合務のパーフェクトレシピ
- 戸羽シェフのチャンネルに首つっこんだ回
- ステッカー試作品
Editorial Notes:
- 今回からマイクがYetiからSM7Bになりました (脇)
- 2024年はとりあえずZAZEN BOYSの12年ぶりの新譜を座禅して待機しています。そういえば向井秀徳がスティーブ・アルビニみたいな音像にしたくてデイブ・フリッドマンをエンジニアにしたとか言ってた (萩)
...more December 19, 2023#70 Transmission 有識者会議、Seattle Hub for SynBio、マイク談義、理論系とのコラボについて雑談。論文紹介は、性周期に依存した報酬予測誤差シグナルの違い、Cas9 RNPそのものを細胞内に導入する手法、マウス用VRゴーグル、細胞種特異的なmiRNAをbulkのRNA seqで読む手法、ヒトからラットへの恐怖伝達、など (12/10 収録)
Show Notes (番組HP):雑談パート
- グローバル・スタートアップ・キャンパス構想に関する有識者会議
- 齋藤さんNR回 1 2
- 使った発表資料(pdf)
- Nature Biotech のChurchラボに関する記事 (pdf)
- ヴィースのHow We Work
- ヴィースのしくみに関する記事
- Business Development人材のリスト
- Allen +UW+CZIのSeattle Hub for Synthetic Biology
- Jay Shendure
- David Baker
- Rui Costa
- 浜崎さん
- 林さん
- 浜崎さんの歴史的な仕事
- コンデンサマイク vs ダイナミックマイク
- Blue Yeti
- Brooks Brothers破産
- 今年のBlack Fridayはそんなに良くない？：10月からの割引が結構あったという話らしい？
- Shure MV7
- Shure SM58
- Shure Beta 87A
- イアンの回
- 昔の北沢さん回
- MOTU M2
- Shure SM7B
- (Geforce RTX) 3090
- Neumann U87 Ai
- U47 Frank OceanがBlondeのレコーディングで使用
- Jeremiah Cohen
- UWのEric Shea-Brown
- 豊泉さん
- Stefan Mihalas
- MindScope終了
- Shaul Druckmann
- 最後の方の稲垣さんの仕事
- Sandro Romani
- M3 Pro Max
論文紹介パート
- 論文１：Estrogenic control of reward prediction errors and reinforcement learning
- Christine Constantinopleラボ
- Randy Brunoラボ
- Brunoラボ時代の仕事
- Thalamo-cortical Axonのターゲットlayerは皮質によって異なる (モダリティではなく一次/二次感覚野の違いでした 脇)
- Bruno、ポスドク時代の超絶技巧
- Larkumラボ
- の上だけ止めるmanipulation：たとえばコレのBaclofen局所投与
- Brodyラボ
- Brodyの所で出した論文 1 2
- 塩野七生
- ローマ人の物語
- コンスタンティノープルの陥落
- 中島さんのCellの仕事
- さやかさん回 1 2 3 4
- タスクの詳細が載ったNature Communicationsの仕事
- Silvia Arber
- optogenetic activation assesses what a neuron can do, but not what a neuron does do
- さやかさんの論文
- AllenのABC Atlas
- GPCRのInternalizationによる不活性化
- DATのアンタゴニストGBR 12909
- 柳下さんの一連の仕事 – Slice: 1; Behavior:2
- George Augustine
- Erwin Neher
- 細胞内カルシウムのモデリングの仕事
- 論文２：Engineering self-deliverable ribonucleoproteins for genome editing in the brain
- Doudnaラボ
- SV40 NLSをつけるとそのまま入る、の論文
- Cell Penetrating Peptide に関するレビュー
- 筆頭著者が同時に出していたLNPによる投与のプレプリント
- Broadの人達がやっているデリバリー 1 2 3
- 論文３： Full field-of-view virtual reality goggles for mice
- Daniel Dombeck
- David Tank
- ２光子顕微鏡の下でマウスを走らせたNeuron論文 (2007)
- 海馬での応用が2010 NN
- Chris Harveyの仕事
- Moserとかがオーサーに入ってる、VR使用時の注意点ディスカッション
- Zemax
- 論文４：Mime-seq 2.0: a method to sequence microRNAs from specific mouse cell types
- Loisa Cochella
- Mime seqその１ in Nat Meth
- miRNAによるAstrocyte以外でのTransgene分解
- glycolRNA Cell 2021
- Bertozzi
- 筆頭著者のRyan Flynn
- 続報プレプリント
- Bertozziは元々糖鎖合成の化学者でした
- 論文５：Rats respond to aversive emotional arousal of human handlers with the activation of the basolateral and central amygdala
- ハンドラーの性によって行動が変わる、の論文
- ラット、かくれんぼする
- ラット、くすぐられて笑う
- Brecht
- Contributed Submissionがなくなった? ->嘘でした、まだあります。
Editorial Notes:
- マイク沼、CPU/GPU沼、対物レンズ沼は奥が深そうで怖い (脇)
- 昔はひたすらマーガレットおばさんのシャツとニットを着てましたが、体がデカくなって着れなくなったので全部捨てて、以降ほぼ全部ユニクロ(か山系)です(萩)
...more
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