阿難白言：大德世尊！我於如來所說契經，不生疑惑，所以者何？一切如來身語意業，無不清淨。世尊！此日月輪，可令墮落；妙高山王，可使傾動，諸佛所言，無有異也。

世尊！有諸眾生信根不具，聞說諸佛甚深行處，作是思惟：云何但念藥師琉璃光如來一佛名號，便獲爾所功德勝利？由此不信，反生誹謗，彼於長夜，失大利樂，墮諸惡趣，流轉無窮。

佛告阿難：是諸有情，若聞世尊藥師琉璃光如來名號，至心受持，不生疑惑，墮惡趣者，無有是處。

阿難！此是諸佛甚深所行，難可信解，汝今能受，當知皆是如來威力。阿難！一切聲聞獨覺，及未登地諸菩薩等，皆悉不能如實信解，惟除一生所繫菩薩。

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所生之子，身分具足，形色端正，見者歡喜，利根聰明，安隱少病，無有非人，奪其精氣。

爾時，世尊告阿難言：如我稱揚彼世尊藥師琉璃光如來所有功德，此是諸佛甚深行處，難可解了，汝為信不？

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復次曼殊室利，若有淨信善男子善女人等，乃至盡形不事餘天，惟當一心歸佛法僧，受持禁戒，若五戒、十戒、菩薩四百戒、苾芻二百五十戒、苾芻尼五百戒、於所受中，或有毀犯，怖墮惡趣，若能專念彼佛名號，恭敬供養者，必定不受三惡趣生。

或有女人，臨當產時，受於極苦，若能至心，稱名禮讚，恭敬供養，彼如來者，眾苦皆除。

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若復有人忽得惡夢，見諸惡相，或怪鳥來集，或於住處百怪出現，此人若以眾妙資具，恭敬供養彼世尊藥師琉璃光如來者，惡夢惡相，諸不吉祥，皆悉隱沒，不能為患。

或有水、火、刀、毒、懸險、惡象、師子、虎、狼、熊、羆、毒蛇、惡蠍、蜈蚣、蚰蜒、蚊、蝱等怖，若能至心，憶念彼佛，恭敬供養，一切怖畏，皆得解脫。

若他國侵擾，盜賊反亂，憶念恭敬彼如來者，亦皆解脫。

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讀誦此經，思惟其義，演說開示。

隨所樂求，一切皆遂。
求長壽得長壽，求富饒得富饒，求官位得官位，求男女得男女。

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南無藥師琉璃光如來(三稱)

南謨薄伽伐帝　鞞殺社寠嚕　薜琉璃鉢喇婆　曷囉闍也　呾他揭多也　阿囉𠿒帝　三藐三勃陀也　呾姪他　唵　鞞殺逝鞞殺逝　鞞殺社　三沒揭帝 莎訶

願消三障諸煩惱　願得智慧真明了
普願罪障悉消除　世世常行菩薩道

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佛告曼殊室利：如是如是，如汝所說。
曼殊室利！若有淨信善男子善女人等，欲供養彼世尊藥師琉璃光如來者，應先造立彼佛形像，敷清淨座而安處之。
散種種花，燒種種香，以種種幢旛，莊嚴其處。
七日七夜，受持八分齋戒，食清淨食，澡浴香潔，著新淨衣。
應生無垢濁心，無怒害心，於一切有情，起利益安樂，慈悲喜捨，平等之心。
鼓樂歌讚，右遶佛像，復應念彼如來本願功德。

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世尊！若於此經受持讀誦，或復為他演說開示，若自書，若教人書，恭敬尊重，以種種花香塗香，末香、燒香、花鬘、瓔珞、旛蓋、伎樂，而為供養。

以五色綵，作囊盛之，掃灑淨處。敷設高座，而用安處。爾時，四大天王與其眷屬，及餘無量百千天眾，皆詣其所，供養守護。

世尊！若此經寶流行之處，有能受持，以彼世尊藥師琉璃光如來本願功德，及聞名號，當知是處，無復橫死，亦復不為諸惡鬼神，奪其精氣，設已奪者，還得如故，身心安樂。

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是故曼殊室利，若有男子女人，於彼藥師琉璃光如來，至心殷重，恭敬供養者，常持此咒，勿令廢忘。
 
復次，曼殊室利！若有淨信男子女人，得聞藥師琉璃光如來應正等覺，所有名號，聞已誦持，晨嚼齒木，澡漱清淨，以諸香花，燒香塗香，作眾伎樂，供養形象。
於此經典，若自書，若教人書，一心受持，聽聞其義。

於彼法師，應修供養，一切所有，資身之具，悉皆施與，勿令乏少。如是便蒙諸佛護念，所求願滿，乃至菩提。

爾時，曼殊室利童子白佛言：世尊！我當誓於像法轉時，以種種方便，令諸淨信善男子善女人等，得聞世尊藥師琉璃光如來名號，乃至睡中，亦以佛名，覺悟其耳。

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爾時光中說此咒已，大地震動，放大光明，一切眾生病苦皆除，受安隱樂。
曼殊室利！若見男子女人，有病苦者，應當一心為彼病人，常清淨澡漱，或食或藥，或無蟲水，咒一百八遍，與彼服食，所有病苦，悉皆消滅。
若有所求，至心念誦，皆得如是，無病延年。
命終之後，生彼世界，得不退轉，乃至菩提。

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