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这项研究利用单细胞多组学技术构建了儿童造血发育图谱，旨在揭示T细胞急性淋巴细胞白血病（T-ALL）产生耐药性和复发的生物学机制。研究人员发现了一种特殊的类骨髓祖细胞（BMP-like）亚群，该细胞群与化疗耐药、微小残留病（MRD）阳性及极低的存活率密切相关。通过对40个病例的深入分析，研究证实了NOTCH1突变能驱动癌细胞脱离这种高危的原始状态，而缺乏此类突变的细胞则表现出更强的干性。此外，该多组学特征能够跨亚型预测患者预后，并识别出BMP-like细胞对凋亡诱导药物（如维奈克拉）的敏感性。这一发现为高危T-ALL的精准风险分层和靶向治疗提供了新的分子基础。

References:

• Xu J, Chen C, Sussman J H, et al. A multiomic atlas identifies a treatment-resistant, bone marrow progenitor-like cell population in T cell acute lymphoblastic leukemia[J]. Nature cancer, 2025, 6(1): 102-122.

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这项研究介绍了一种名为 SMMILe 的计算病理学新方法，旨在解决数字化切片分析中空间量化准确性不足的问题。研究人员指出，传统的多实例学习（MIL）模型虽然能有效预测整张切片的标签，但往往会丢失关键的空间解剖细节。SMMILe 通过引入超像素（Superpatch）机制和马尔可夫随机场（MRF）优化，实现了在不牺牲分类精度的前提下，对组织微环境进行精准定位。该系统在涵盖六种癌症类型的八个数据集上进行了验证，其表现显著优于现有的九种主流算法。无论使用通用的图像编码器还是专业的病理大模型，SMMILe 均展现出卓越的鲁棒性和临床引导潜力。这种技术能够生成更加精细的空间分布图，为病理学家的诊断提供更具解释性的决策支持。

References:

• Gao Z, Mao A, Dong Y, et al. SMMILe enables accurate spatial quantification in digital pathology using multiple-instance learning[J]. Nature Cancer, 2025: 1-17.

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这项研究通过构建多组学细胞与空间图谱，深入探讨了 TP53 基因突变如何重塑肺腺癌的肿瘤微环境。研究发现，携带突变基因的癌细胞不仅失去了正常的肺泡特征，还表现出高度的细胞可塑性以及与恶性进展相关的基因活跃度。在突变肿瘤中，研究人员识别出由特定巨噬细胞和成纤维细胞构成的多细胞生态位，这与肿瘤的缺氧和转移倾向密切相关。此外，TP53 突变还导致肿瘤内血管成分减少，并富集了多种免疫检查点相互作用。这些发现不仅揭示了基因型如何驱动复杂的肿瘤生态系统，也为提升肺癌精准医疗及免疫治疗效果提供了关键的理论依据。

References:

• Zhao W, Nguyen T T, Bhagwat A, et al. A cellular and spatial atlas of TP53-associated tissue remodeling defines a multicellular tumor ecosystem in lung adenocarcinoma[J]. Nature Cancer, 2025, 6(11): 1857-1879.

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这项研究通过结合激光捕获显微切割与单核转录组测序技术，详细绘制了人类胎儿小脑在发育过程中的分子与细胞图谱。研究人员分析了从受孕后9到21周的样本，识别出21种不同的细胞类型，并重点揭示了人类特有的菱唇（Rhombic Lip）祖细胞生态位及其演化路径。通过对比小脑空间区域与单细胞数据，该研究构建了一个全面的发育细胞图谱，填补了以往数据库中对人类早期小脑研究的空白。此外，研究还通过对比人类与小鼠的转录组差异，确定了与自闭症和阿尔茨海默病等神经系统疾病相关的特定细胞类型。这一资源为理解人类小脑的正常发育机制及其在疾病中的功能异常提供了关键的分子基础。

References:

• Aldinger K A, Thomson Z, Phelps I G, et al. Spatial and cell type transcriptional landscape of human cerebellar development[J]. Nature neuroscience, 2021, 24(8): 1163-1175.

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这项发表在《Nature Cancer》的研究通过构建名为 TabulaTIME 的泛癌症单细胞图谱，对 36 种癌症类型的 肿瘤微环境 进行了深度解析。研究人员整合了来自 746 名患者的约 450 万个细胞，识别出 56 种细胞亚型，并重点发现了一种以 CTHRC1 为标记的促纤维化癌症相关成纤维细胞（CAF）。这种 CTHRC1+ 成纤维细胞 主要聚集在恶性组织与正常组织的交界处，可能起到了阻碍 免疫细胞浸润 的屏障作用。此外，研究还揭示了 SLPI+ 巨噬细胞 与这些成纤维细胞共同构成了独特的空间生态型，且其高表达与患者预后不良显著相关。该资源不仅为 细胞类型注释 提供了综合参考，也为针对肿瘤基质和促纤维化环境的 治疗策略 开发提供了新方向。

References:

• Han Y, Zhang L, Sun D, et al. Spatiotemporal analyses of the pan-cancer single-cell landscape reveal widespread profibrotic ecotypes associated with tumor immunity[J]. Nature Cancer, 2025, 6(11): 1880-1898.

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这项发表在《Nature Cancer》的研究介绍了名为SWIFT-seq的单细胞测序工作流，旨在为多发性骨髓瘤及其癌前病变提供一种非侵入性的检测手段。通过对101名受试者的血液和骨髓进行配对分析，研究者证明了利用循环肿瘤细胞（CTCs）进行单细胞转录组和B细胞受体测序的可行性。该技术不仅能精准计数血液中的肿瘤细胞，还能在仅有10个细胞的情况下准确推断细胞遗传学异常。此外，研究揭示了循环肿瘤细胞能完整反映骨髓病灶的克隆演化动态和肿瘤增殖水平。最终，研究提出了一个整合肿瘤负荷、增殖指数及循环能力特征码的模型，阐明了肿瘤细胞进入血液的生物学机制。这种方法有望取代部分侵入性的骨髓活检，提升多发性骨髓瘤的临床诊断、预后评估和日常监测水平。

References:

• Lightbody E D, Sklavenitis-Pistofidis R, Wu T, et al. SWIFT-seq enables comprehensive single-cell transcriptomic profiling of circulating tumor cells in multiple myeloma and its precursors[J]. Nature Cancer, 2025, 6(9): 1595-1611.

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这项研究揭示了癌细胞通过细长的隧道纳米管（TNTs）向成纤维细胞传递线粒体的生物学机制。这种线粒体转移会诱导成纤维细胞发生代谢改变，并使其分化为癌相关成纤维细胞（CAFs）。研究指出，该过程关键取决于线粒体运输蛋白 MIRO2，下调该蛋白可有效抑制线粒体交换及肿瘤生长。分化后的成纤维细胞会释放促进肿瘤发展的分泌组和基质组，从而在临床前模型中加速癌症进展。临床观察进一步证实，MIRO2 在皮肤癌边缘高度表达，显示了该机制在人类恶性肿瘤中的相关性。这些发现为通过干扰线粒体转移来阻断肿瘤微环境的恶化提供了新的治疗思路。

References:

• Cangkrama M, Liu H, Wu X, et al. MIRO2-mediated mitochondrial transfer from cancer cells induces cancer-associated fibroblast differentiation[J]. Nature Cancer, 2025, 6(10): 1714-1733.

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这项研究揭示了前列腺基底细胞在Pten基因缺失后转化为肿瘤的分子机制。研究发现，这种细胞的可塑性和重编程过程具有明显的区域差异性，其中前叶和背侧前列腺的基底细胞更易通过一种中间状态演变为浸润性腺癌。实验进一步表明，该重编程过程与先天免疫通路及NF-κB信号的激活密切相关。通过联合使用Pik3ca突变或p53缺失，科研人员观察到基底细胞向管腔细胞转化的速度显著加快。最后，研究证实利用药物抑制mTOR、JAK-STAT或NF-κB通路可以有效阻断这种细胞命运的转变。这些发现为前列腺癌的早期干预和临床治疗提供了潜在的新靶点。

References:

• Jiang C, Song Y, Rorive S, et al. Innate immunity and the NF-κB pathway control prostate stem cell plasticity, reprogramming and tumor initiation[J]. Nature Cancer, 2025, 6(9): 1537-1558.

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这项研究指出，骨骼肌内皮功能障碍是导致癌症恶病质（肌肉萎缩）的核心驱动因素。研究人员通过多种肿瘤模型发现，肌肉血管密度的降低实际上发生在肌肉萎缩之前，这一现象在癌症患者身上也得到了验证。研究揭示了肿瘤释放的激活素 A（Activin A）会抑制肌肉血管内皮中的 PGC1α 表达，进而引发血管渗漏和功能衰竭。实验证明，修复内皮细胞中的 PGC1α 活性能够有效维持血管密度并减缓肌肉流失。因此，针对改善血管内皮功能而非仅仅针对肌肉本身，可能成为治疗癌症恶病质的新策略。

References:

• Kim Y M, Sanborn M A, Vijeth S, et al. Skeletal muscle endothelial dysfunction through the activin A–PGC1α axis drives progression of cancer cachexia[J]. Nature Cancer, 2025, 6(8): 1350-1369.

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这项研究揭示了胶质母细胞瘤（GBM）如何通过与小胶质细胞及巨噬细胞（TAM）的相互作用，实现从团块生长向浸润性生长的转变。研究发现，小胶质细胞在肿瘤扩散前便已在肿瘤场中被激活，并逐步演变为围绕浸润灶的“神经胶质网”，最终形成引导肿瘤细胞集体迁徙的“肿瘤流”（oncostreams）。通过单细胞测序技术，科学家识别出了对应不同入侵生态位的特定基因特征，并证实了Plexin-B2受体在重构细胞外基质及对齐入侵路径中的核心作用。实验表明，敲除TAM中的Plexin-B2会破坏这种自组织的迁移轨道，迫使肿瘤生长模式从扩散浸润转变为局限性的团块扩张。这些发现不仅阐明了肿瘤微环境对癌症侵袭性的调节机制，也为遏制胶质母细胞瘤扩散提供了潜在的治疗靶点。

References:

• Kang S, Ughetta M E, Zhang J Y, et al. Glioblastoma shift from bulk to infiltrative growth is guided by plexin-B2-mediated microglia alignment in invasive niches[J]. Nature cancer, 2025, 6(9): 1505-1523.

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