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By 淼淼ElvaScience
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聊聊Sci episodes

  • 1672-基于图学习的肿瘤相关近缘抗原发现研究

    本研究开发了一种高通量细胞膜蛋白邻近度测绘技术,通过绘制12种受体酪氨酸激酶在28种肿瘤细胞系统中的248张空间邻近图谱,揭示了传统表达量分析无法捕捉的细胞表面蛋白空间组织结构。研究团队进一步构建了MetaMap相关性分析框架与图机器学习模型,成功突破了单纯依赖表达水平的局限,提出了肿瘤相关邻近抗原(TAPA)这一全新靶标概念。通过整合多组学数据,研究识别并验证了EGFR-CDCP1这一核心肿瘤抗原与邻近抗原配对,证实双特异性抗体偶联药物对其进行共靶向能够显著增强肿瘤杀伤效果。该工作为理解细胞表面生物学以及设计下一代多特异性精准抗肿瘤疗法奠定了坚实的方法学与理论基础。

    References:

    • Scandore C, Malone C F, May C K, et al. Proximity-guided graph learning reveals tumour-associated proximity antigens[J]. Nature, 2026: 1-11.


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    20 min
  • 1671-成年小鼠大脑的膜脂架构的三维空间

    本文利用基质辅助激光解吸电离质谱成像技术,对成年小鼠大脑的膜脂架构进行了微米级的三维空间测绘。研究发现,脑内脂质的分布呈现出精细的生化结构并与功能解剖学高度契合,这些空间异质性聚类被命名为“脂区(lipizones)”。该脂质图谱不仅揭示了灰质脂质组学的组织原则、白质中少突胶质细胞的新异质性,还发现脑室壁和脉络丛存在生化区带。此外,这种脂质架构能够适应不断变化的生理需求,例如在怀孕小鼠的大脑中会发生特定的重塑现象。研究还表明,脂区的分布与细胞类型 territories以及中尺度脑连接密切相关,为理解脑部发育、生理和病理中的脂质作用奠定了基础。

    References:

    • Fusar Bassini L, Schede H H, Capolupo L, et al. The lipidomic architecture of the mouse brain[J]. Nature, 2026: 1-13.


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    21 min
  • 1670-致死性转移性膀胱癌亚型的演化与异质性

    本研究利用快速尸检计划,通过全基因组测序、RNA测序和多组学分析,深入探讨了转移性膀胱癌及其多种组织学亚型的进化轨迹与基因组异质性。研究发现,转移灶之间的播散是癌细胞扩散的主要模式,且多克隆迁移往往预示着更差的临床预后。不同组织学亚型在基因组变异、肿瘤微环境及生存时间上表现出显著差异,其中浆细胞样癌和神经内分泌亚型因早期出现致病性驱动变异而导致生存期更短。此外,通过检测死后游离DNA(cfDNA),研究证实其能够有效捕获转移灶的异质性,为非侵入性评估肿瘤侵袭性提供了新策略。

    References:

    • Itagi P, Schuster S L, Arora S, et al. Evolution and heterogeneity of lethal metastatic bladder cancer subtypes[J]. Nature, 2026: 1-12.


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    16 min
  • 1669-蓝斑核去甲肾上腺素神经元的拓扑结构与功能

    本文献研究了小鼠蓝斑去甲肾上腺素能神经元(LC-NE)的空间结构、基因表达特征及其在行为学习中的功能。研究发现,这些神经元在解剖学上呈现地形学组织,其胞体在背腹轴上的位置与轴突投射目标及基因表达的梯度变化密切相关。背侧神经元主要投射至前脑区域并在决策切换和奖赏预测误差信号中表现活跃,而腹侧神经元则多投射至后脑并在忽视刺激的背景下保持更高活性。通过整合单细胞测序、空间转录组学与电生理记录,该研究揭示了去甲肾上腺素系统并非均匀分布,而是包含空间有序的多种神经元亚群,从而为灵活行为提供了关键的学习信号。

    References:

    • Su Z, Kosillo P, Jung K, et al. Topographic structure and function of locus coeruleus noradrenaline neurons[J]. Nature, 2026: 1-10.


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    21 min
  • 1668-蝙蝠基因组与化石揭示的演化与地理起源研究

    该研究整合了来自全部21个现生蝙蝠科的103个染色体水平基因组与大量化石形态学数据,构建了全新的蝙蝠基因组系统发育树。通过创新性的系统基因组学分析,研究人员重新厘清了蝙蝠各超科的演化关系,并将美洲吸足蝠科准确归入蝙蝠总科。研究结果表明,现代蝙蝠及其标志性的动力飞行能力很可能起源于晚古新世的欧洲,而喉鸣回声定位的演化则早于冠群蝙蝠的分化。此外,该工作重建了包含26条染色体的蝙蝠祖先核型,并揭示了蝙蝠基因组在演化过程中以染色体融合为主导的规律。通过采用结合化石与分子钟的“全证据测年”模型,该研究不仅大幅减少了缺失的基底支系长度,还修正了以往对蝙蝠物种分化与灭绝速率的估计。最后,结合生物地理学扩散-灭绝-分化模型,研究推测蝙蝠祖先随后通过欧洲与非洲的枢纽向全球扩散,在早始新世气候适宜期迎来了各大超科的快速辐射演化。

    References:

    • Morales A E, Liang Y, Thomas W R, et al. Reference genomes and fossils revise bat family phylogeny and biogeography[J]. Nature, 2026: 1-12.


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    19 min
  • 1667-胰腺癌免疫逃逸中的丝氨酸蛋白酶抑制剂与髓系细胞轴

    这篇研究表明胰腺导管癌(PDAC)能够利用SERPINE1(PAI1)和SERPINB2(PAI2)这两种丝氨酸蛋白酶抑制剂来建立免疫逃逸微环境。通过空间功能基因组学分析发现,癌细胞表达的这些血清蛋白酶抑制剂可以促进富含纤维蛋白的基质生态位形成,从而在空间上锚定并驱动巨噬细胞转向免疫抑制状态,同时排斥和耗竭细胞毒性CD8+ T细胞。实验证明,基因敲除这些目标基因、使用PAI1抑制剂或阻断CD18能够重塑肿瘤微环境,显著抑制肿瘤生长并增强抗PD-1免疫疗法的效果。这些发现揭示了肿瘤异质性与免疫治疗耐药之间的关键机制,为改善胰腺癌治疗提供了潜在的组合疗法策略。

    References:

    • Falcomatà C, Schaefer M M, Singh B, et al. A serpin–myeloid axis in pancreatic cancer heterogeneity and immune evasion[J]. Nature, 2026: 1-11.


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    29 min
  • 1666-TM184C:调控自噬与细胞连接的类GPCR蛋白研究

    本文探讨了人类蛋白质组中未被充分研究的“黑暗蛋白质组”,并利用先进的AlphaFold2模型和结构比对工具发现了一类被称为“超深暗7TM家族”的新型七跨膜蛋白。研究人员聚焦于其中最古老且广泛表达的TM184C蛋白,发现它虽然缺乏典型的G蛋白偶联,但却表现出类似GPCR的特性,能够招募β-抑制蛋白(β-arrestin)和GPCR激酶(GRK)。此外,TM184C定位于动态细胞内囊泡,在促进细胞间连接和调节自噬流方面发挥着至关重要的作用。这些发现拓宽了我们对细胞生物学的认知,并揭示了基于结构的蛋白质发现在解析未知蛋白质功能方面的巨大潜力。

    References:

    • Lee K D, Taylor S, Arcuri J, et al. TM184C is a GPCR-like regulator of intercellular exchange and autophagy[J]. Nature, 2026: 1-11.


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    22 min
  • 1665-PLA2G2D:调节肿瘤引流淋巴结抗肿瘤免疫的新型免疫检查点

    本文研究了肿瘤引流淋巴结(TDLN)中PLA2G2D蛋白在调节抗肿瘤免疫和癌症进展中的核心作用。研究发现,复发患者淋巴结副皮质区高度表达免疫抑制分子PLA2G2D的巨噬细胞显著增加,这与不良预后密切相关。通过基因敲除或使用中和抗体抑制PLA2G2D,能够显著恢复CD8+ T细胞的增殖与功能,从而有效抑制肿瘤生长。此外,阻断PLA2G2D与PD-1抑制剂联用展现出显著的协同抗肿瘤疗效,为癌症免疫治疗提供了全新的靶点。

    References:

    • van Krimpen A, Huang J, Eterman M, et al. PLA2G2D in tumour-draining lymph nodes regulates anti-tumour immunity[J]. Nature, 2026: 1-11.


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    19 min
  • 1664-前列腺癌突变过程的整合特征研究

    这项研究通过分析近千名患者的全基因组数据,揭示了驱动前列腺癌发生与演变的复杂突变过程。研究人员整合了单碱基替换、拷贝数变异以及六种新发现的复杂结构变异特征,构建出八种“综合突变足迹”(IMFs)框架。这些足迹不仅揭示了雄激素受体介导的诱变和复制压力等基因组偏好,还成功解释了约85%的原发性病例。研究强调,特定的突变足迹与患者的临床预后密切相关,能够有效预测癌症转移风险及对雄激素途径抑制剂的治疗敏感性。这一发现为前列腺癌的风险分层和精准医疗提供了重要的生物标志物指南。

    References:

    • Gruber A J, Olsen A V, Hernando B, et al. Integrated signatures define mutational processes in prostate cancer[J]. Nature, 2026: 1-11.


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    24 min
  • 1663-人类脑部疾病单细胞转录组脆弱性图谱

    该研究通过构建PsychAD队列,建立了一个规模庞大的人类大脑单细胞转录组图谱,涵盖了来自近1500位捐赠者的630万个细胞核。研究团队针对阿尔茨海默病、精神分裂症及双相情感障碍等八种神经及精神疾病,深入分析了不同病理状态下的基因表达差异与细胞组成变化。研究揭示了跨疾病的普遍分子特征,例如mRNA处理和蛋白定位的异常,同时也确定了不同疾病间在遗传与转录层面的关联性。此外,该图谱详细描绘了阿尔茨海默病随病程进展的细胞轨迹,发现严重患者的神经元数量减少,而免疫与血管细胞比例上升。这些发现不仅阐明了脑部疾病中神经、免疫与血管系统间的复杂互动,也为开发精准治疗手段提供了重要的分子靶点。

    References:

    • Lee D, Koutrouli M, Masse N Y, et al. Single-cell atlas of transcriptomic vulnerability across brain disorders[J]. Nature, 2026, 657(8133): 988-1002.


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    17 min

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