Durante los primeros 100 días del régimen de excepción, el Instituto de Derechos Humanos de la UCA reportó 219 casos de detenciones arbitrarias, en los que resultaron 254 personas afectadas.
Por su parte, Cristosal reportó 1,941 casos, en los que resultaron 2,023 personas afectadas. Además, hasta el 19 de julio ha registrado 63 muertes de personas privadas de libertad, durante el Régimen de Excepción.
Estas graves vulneraciones a derechos humanos están registradas en el informe del Observatorio de Derechos Humanos de la UCA, OUDH, 100 días de Régimen de Excepción en El Salvador, el cual también registra 123 muertes violentas, durante dicho periodo, a nivel nacional.
El coordinador general del OUDH, Danilo Flores, señala que el conjunto de instituciones encargadas de tutelar los derechos humanos en el país, no están investigando las denuncias de la población en el marco del régimen de excepción.