古希腊的那些原子论者已经把有关于原子的概念摆在我们面前了。可是，无所不知、无处不在的全能神的存在，把对物质世界本质的哲学探究卷入了无休止的争论之中。直到17和18世纪情况才有所改观，在中间的这十几个世纪里，不是没有哲学家的探讨、辩论以及重要的结论。这段时间，西方哲学家的大部分注意力都放在如何将古希腊和罗马的哲学与“亚伯拉罕”诸教（即基督教、犹太教、伊斯兰教）的神学相互调和的这一挑战之上。