Independent assessment of the origins of SARS‑CoV‑2

Developed by the Scientific Advisory Group for the Origins of Novel Pathogens (SAGO)

https://www.who.int/publications/m/item/independent-assessment-of-the-origins-of-sars-cov-2-from-the-scientific-advisory-group-for-the-origins-of-novel-pathogens

新型病原体の起源に関する科学諮問グループ（SAGO）は、2022年6月9日に発表された報告書（WHO, 2022）において、SARS-CoV-2の起源をよりよく理解するための最初の知見と勧告を提示した。

今回のレビューは、SAGOがWHOのために作成したSARS-CoV-2の起源に関する独立した評価であり、発表された科学論文や報告書、入手可能な情報声明や報告書、SAGOに提供された科学的プレゼンテーション、2021年11月から2025年6月にかけてSAGOが非公開会合で行った専門家による議論から得られた情報を評価したものである。

SAGOは2021年11月から2025年6月にかけて非公開会合を開催した。SARS-CoV-2の起源とパンデミックの発端を解明することは、将来のパンデミックを予防し、人命と生活を守り、世界の苦しみを軽減するために必要である。結局のところ、この追求は、人類の健康と福祉を守る私たちの連帯責任を強調するものなのである。

この文書はまた、SARS-CoV-2の起源についての理解を深め、将来のパンデミックを予防するために、さらに推奨される研究や、できるだけ早くすべての情報を共有することの重要性について提言している。

Human microbiome acquisition and transmission

Citation
Nature Reviews Microbiology (2025)

論文の要約
本レビューでは、ヒトが出生から終生にわたり獲得する個別のマイクロバイオームが、どのように獲得・伝播されるかについて、最新のメタゲノム研究に基づき総合的に解説している。

• 獲得と伝播のライフコース
  出生時（膣分娩・帝王切開）から授乳期、さらには家族・社会環境との接触を通じて、細菌、酵母やウイルスなどの微生物ストレインがヒト間で交換されるプロセスを詳細に論じている。

• 一個別ストレインレベルでの追跡
  稀なストレイン固有性に基づき、メタゲノム解析および解析パイプラインによって、どのようにして感染源や伝播ルートを特定できるかを実証的に示している。

• 環境と動物由来の微生物寄与
  初期の証拠として、人獣接触や食品を介した微生物獲得の可能性も指摘されており、これを「One‑Health」視点から解析する必要性を強調している。

• 公衆衛生・臨床応用
  幼少期の免疫教育、感染症予防、疾患リスク評価における微生物伝播の理解が、将来的なプロバイオティクス戦略や感染連鎖制御にどう応用され得るかについて展望されている。

本レビューは、出生から日常的接触までを横断するマイクロバイオームの獲得と伝播を包括的に整理し、感染症や免疫発達の研究者にとって示唆に富む内容である。

Interventions for the management of long covid (post‑covid condition): living systematic review

Citation
The BMJ, bmj‑2024‑081318

論文の要約
本論文は、Long COVID（COVID‑19回復後3か月以上持続する症状）に対する様々な介入の有効性を評価したリビング・システマティック・レビューである。24件のランダム化比較試験、対象患者数は計3,695名にのぼる。

• 認知行動療法（CBT）
  オンライン形式のCBTプログラムが疲労の軽減および認知機能の改善におそらく有効であるという中程度の確からしさの証拠が得られた。

• 身体および精神リハビリプログラム
  オンラインで監視・指導がなされる組み合わせ型プログラムは、回復や重要な改善を経験する患者の割合を増加させ、抑うつ症状の軽減や生活の質の改善にもおそらく有効とされた。

• 断続的有酸素運動
  週3〜5回、4〜6週間の断続的運動は、継続的運動と比べて身体機能をおそらく改善する可能性が中程度の確からしさで示された。

• その他の介入
  抗うつ薬（ボルチオキセチン）、抗体治療（レロンリマブ）、プロバイオティクス・プレバイオティクス、コエンザイムQ10、モバイルアプリ教育、呼吸筋訓練、高圧酸素療法、脳トレーニングなどには、「確かな効果なし」とされたか、エビデンスの質が低く評価された。

本レビューは、臨床的に意味ある改善をもたらす可能性のある介入を明示している一方で、対象となった試験の多くが患者選択や盲検の欠如などのバイアスのリスクを伴う点も強調している。さらに、多くの試験が入院歴のある重症例を対象としており、一般の軽症例に対して結果の一般化は慎重を要する。

臨床的意義：CBTおよび監督付きリハビリプログラムは、Long COVID 患者の症状改善における「有望な介入」として位置づけられる。ただし、選択・設定バイアスや障害の軽重などを考慮した上で、個別化した治療方針を策定する必要がある。

Long COVID: a clinical update

Citation
DOI: 10.1016/S0140-6736(24)01136-X

論文の要約
本レビューは、COVID‑19回復後3か月以上持続する多様な症状群（post‑COVID‑19 condition または Long COVID）について、最新の臨床知見を統合的に整理している。

• 定義と疫学：重症例では50〜85％、非入院例でも10〜35％がLong COVIDを経験し、ワクチン接種者では8〜12％に症状が残存する。

• 臨床症状の多様性：倦怠、認知機能障害（脳霧）、呼吸困難、睡眠障害などが複数臓器にわたって持続・変動的に出現する。

• 回復の予後因子：急性期の重症度が低く、症状持続期間が短く、ワクチン接種歴がある場合、回復率が高い傾向がある。一方、症状が6か月〜2年以上続く例では回復の可能性が低下する。

• 病態メカニズムの仮説：持続的免疫活性化（例：インターフェロンγの上昇）、微小血管障害、自己免疫反応、神経代謝不調など複合的機構が関与するとされている。

• 治療と公衆衛生的対応：ワクチン接種によりLong COVID発症率は低下（2回接種で約37％、3回接種で約69％の減少）、抗ウイルス薬（モルヌピラビル、ニルマトレルビル）も症状軽減に寄与する可能性が示唆されている。

• 今後の展望：包括的クリニック設置、リハビリテーション、デジタルヘルスと統合した継続支援、さらにランダム化試験による有効療法のエビデンス構築が求められる。

本レビューは、Long COVID の概念整理から診療戦略・予防策まで広範な視点をカバーしており、臨床医、疫学者、公共衛生政策立案者にとって極めて重要な内容を提供している。

Ecology, global diversity and evolutionary mechanisms in the Mycobacterium tuberculosis complex

Citation
Nature Reviews Microbiology (2025)

論文の要約
本レビューは、結核菌複合体（MTBC：Mycobacterium tuberculosis complex）の地球規模における多様性、生態的分布、および進化的な適応メカニズムについて総合的に解説している。

• 生態的多様性と地域差
  著者らは、MTBCを構成する複数の系統（lineage）が地理的に特定の地域と関連し、地域住民の遺伝背景や生活様式との共進化が見られることを示している。

• 進化的メカニズム
  MTBCの進化は、主に塩基変異と選択圧のもとで進み、水平伝播が極めて少ないクローン性の進化を経る。一部の研究では、病原性獲得や持続感染における遺伝子増幅（duplication）や突然変異の役割が浮かび上がっている。

• 宿主との相互作用
  宗教、栄養状態、共感染（HIVなど）、生活環境の違いがMTBC感染ダイナミクスに影響を及ぼし、地域ごとの疫学的特徴につながっている。

• 感染伝播と公衆衛生的意義
  異なる系統間での伝播力に違いがあり、感染拡大リスクの評価には系統分析が重要であることが強調される。古来の病原体動態の理解だけでなく、ワクチンや治療戦略の最適化にも繋がる知見である。

本論文は、結核の流行制御や新規治療・予防法開発に向け、微生物進化学的視点と公衆衛生的アプローチを融合させた包括的な解析を提供するものであり、感染症研究者や疫学者、疾患モデル開発者にとって重要な資料である。

Clinical Characteristics of Campylobacteriosis in Cases with Immunosuppressive Conditions

Citation
OFID, ofaf406, https://doi.org/10.1093/ofid/ofaf406

論文の要約
本後ろ向きコホート研究は、免疫抑制状態にある患者におけるカンピロバクター症の臨床的特徴を明らかにしたものである。

• 研究対象：複数施設の免疫抑制患者を対象に、カンピロバクター感染例の臨床所見、重症化因子、治療経過を詳細に解析した。

• 主な所見：発熱や下痢は典型的だが、免疫抑制下ではしばしば敗血症や播種性感染のリスクが高く、入院率や集中治療室入室率が非免疫抑制患者に比べ増加する傾向にあった。

• 治療応答：疾患軽快までの時間は延長する傾向にあり、抗菌薬選択についてはマクロライド系またはニューキノロン系が考慮される。重症例では治療戦略の最適化や早期の専門家介入が重要とされた。

• 臨床的意義：免疫抑制患者においてカンピロバクター症は単なる胃腸炎にとどまらず、重篤な全身感染を引き起こし得る。臨床医は速やかな診断と重症化予防を念頭に治療に当たるべきである。

本論文は、免疫抑制状態の患者に関する感染症診療における重要な知見を提供し、実臨床における早期対応と抗菌薬戦略の再考を促す内容となっている。

A 10 year Multicentre clinical and genomic surveillance of listeriosis across Japan

Citation
Journal of Infection, S0163‑4453(25)00146‑X, https://doi.org/10.1016/j.jinf.2025.01.046

論文の要約
本研究は、2011年から2021年にかけて日本全国24施設で実施された多施設後ろ向き研究であり、リステリア症（Listeria monocytogenes感染症）の臨床像とゲノム特性を統合的に解析した。

対象となった195例の非周産期症例のうち、17％（31例）は院内発症（入院3日目以降の発症）であり、これらは固形腫瘍や化学療法などの免疫抑制状態との関連が顕著であった。院内発症例は中枢神経系合併症を起こす頻度が低く、院内死亡率は地域発症例とほぼ同程度であった。

ゲノム解析では、院内発症例ラックに由来する19株、地域発症例由来76株を対象に、コアゲノム多型解析を実施し、院内発症株はクローン性の多様性が高く、リスクの高いCC1クローンは低頻度であることが明らかとなった。

本研究は、免疫抑制状態下における院内リステリア症の発生実態と、そのゲノム的背景を明らかにした初の全国規模解析であり、予防・監視戦略の拡充に向けた重要な基盤情報を提供するものである。

Global health perspectives on antibacterial drug discovery and the preclinical pipeline

Citation（形式）
Nature Reviews Microbiology (2025)

論文の要約
本レビューは、多剤耐性菌の蔓延という世界的課題を背景に、抗菌薬開発の現状と前臨床段階までのパイプラインを俯瞰的に整理している。著者らは多数の治療薬候補を対象に、その創薬戦略の多様性と革新性を示しつつも、臨床成功率の低さや高い開発費用という障壁が継続的に存在している点を指摘している。

新規開発の多くは既存薬の改良型である一方で、作用機序の異なる化合物群（リポソーム合成阻害、脂質A前駆体阻害、ペプチドグリカンまたはイソプレノイド代謝標的など）も前臨床段階に多数存在する。一部はクロス耐性を回避できる可能性があるが、収益見込みの低さから資金調達や市場展開に遅れが生じることが課題とされている。

また抗菌薬単独では対応困難な感染症に対して、バクテリオファージ療法や抗ウイルス併用治療といった代替戦略の潜在的有用性も論じられており、エコシステムとして統合的に対策を講じる必要性が強調されている。

本論文は、バイオ医薬品産業、感染症制御、公衆衛生政策に関わる研究者・臨床家・政策立案者を対象に、現状の課題と今後の可能性を示す一読に値するレビューである。

Severe Fever with Thrombocytopenia Syndrome Acquired through Dog Bite, South Korea

Citation
EID, 31(8):2025年

論文の要約
本症例報告では、韓国で犬に咬まれた男性患者が、重症熱性血小板減少症候群ウイルス（SFTSV）に感染した珍しい事例が紹介されている。

• 患者背景と経過
  　中高年男性が愛犬に咬まれた数日後に発熱、血小板減少、白血球減少などの典型的なSFTS症状を発症。ウイルスRNA検出および犬咬傷部位からのSFTSV分離が確認された。

• 診断的意義
  　従来、主な感染経路はマダニ咬傷と考えられてきたが、本症例は犬を介したSFTSVの直接感染を示しており、動物〜ヒトへの経路に関する臨床的注意が必要である。

• 疫学的背景
  　韓国では犬にSFTSVが感染している例が確認されており、飼育動物は潜在的な感染源である可能性が示唆される（犬からのウイルス検出例あり）

• 公共衛生的インプリケーション
  　犬を含むペットが感染源となりうることから、咬傷時のウイルス検査、飼い主への注意喚起、動物医療とヒト医療の連携による予防策（ワクチン開発を含む）が求められる。

本報告はSFTSV感染に関する理解を拡張し、動物由来感染症としてのSFTS対応の枠組みを再考する契機となる内容である。

COVID-19-associated Pulmonary Aspergillosis in Mechanically Ventilated Patients at 7 US Hospitals: Epidemiology and Estimated Likelihood of Invasive Pulmonary Aspergillosis—Results of the Prospective MSG-017 Study

Citation
OFID, ofaf331, https://doi.org/10.1093/ofid/ofaf331

論文の要約
本研究は、COVID-19関連肺アスペルギルス症（CAPA）の発生頻度と、そのうち侵襲性肺アスペルギルス症（IPA）である可能性を評価した、米国7施設における前向き多施設研究である。

対象はCOVID-19により人工呼吸管理を受けた重症患者212例であり、CAPA診断にはMSGERC基準（臨床所見、画像所見、BAL培養またはガラクトマンナン抗原検査など）を使用した。その結果、CAPAの発生率は7%（14例）であり、そのうち1例が「証明されたIPA」、11例が「仮定的IPA」、2例が「IPAとは考えにくい」と分類された。仮定的IPAのうち一部は生検や剖検を行わず診断されており、真のIPAかどうかの確証は得られていない。

試験において、CAPAの診断には単一の陽性検査（例：BAL GM-EIA）のみでは不十分であり、複数検査の組み合わせと陰性結果の考慮が必要であることが示唆された。CAPA患者の90日死亡率は71%と高かったが、抗真菌薬治療の有無やCAPAの有無によって死亡率に有意な差はなかった。

また、本研究では欧州のECMM-ISHAMやPHW-MRCの定義と比較してMSGERC定義のほうがより厳格であり、他定義でCAPAとされた患者の多くが実際にはIPAではない可能性が高いと推定されている。

本研究は、CAPAの診断精度と臨床的意義についての再評価を促すものであり、人工呼吸管理中のCOVID-19患者におけるIPA診断と治療の在り方に重要な示唆を与えている。