这项研究介绍了一种名为
SpaceBar 的新技术,该技术通过将
组合式条形码标签与
空间转录组学相结合,实现了在组织中同时追踪
细胞克隆谱系与
基因表达模式。研究人员设计了一套由 96 种合成序列组成的文库,使标准成像技术能够以
单细胞分辨率区分细胞的遗传祖先及其空间位置。通过对黑素瘤模型的分析,该方法揭示了肿瘤内的基因表达主要受
空间环境驱动,但某些特定基因也表现出显著的
克隆遗传性。这种方法克服了以往技术在空间分辨率和条形码检测方面的局限,为研究癌症、发育及再生过程中
细胞内在因素与
外部环境的相互作用提供了有力工具。该成果发表于 2025 年的《
自然-方法》杂志,展示了其在复杂组织背景下精确区分克隆动力学与环境调控的能力。
References:
- Kinsler G, Fagan C, Li H, et al. SpaceBar enables single-cell-resolution clone tracing with imaging-based spatial transcriptomics[J]. Nature Methods, 2025: 1-6.
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