Además de Arabidopsis thaliana, otras plantas modelo importantes incluyen Zea mays (maíz), Oryza sativa arroz), Medicago truncatula (alfalfa), Brachypodium distachyon y Solanum lycopersicum (tomate). Estas plantas son utilizadas por su relevancia económica, diversidad genética, y características específicas que facilitan estudios de genética, fisiología y biotecnología vegetal.
El maíz y el arroz son esenciales para estudios de monocotiledóneas y cultivos alimentarios. Medicago truncatula es clave en estudios de leguminosas y simbiosis con bacterias fijadoras de nitrógeno. Brachypodium distachyon es una gramínea modelo, mientras que el tomate se estudia por su relevancia en biología de frutos y patología vegetal.