Margarita fue la última hija que le sobrevivió a la emperatriz María, hermana de Felipe II, de su matrimonio con el emperador Maximiliano de Austria. En 1582 llega a España con su madre para instalarse en las Descalzas Reales, donde entra en religión.

A pesar de su condición religiosa, sor Margarita de la Cruz tuvo un papel activo en la vida cortesana de la Corte de su sobrino Felipe III y mantuvo un estrecho contacto con éste y con su esposa, la reina Margarita.

Fue la primera clarisa Habsburgo del siglo XVII en las Descalzas. Después la seguirían Ana Dorotea de Austria-que coincidió con ella-; sor Mariana de la Cruz y la hija natural de don Juan José de Austria, también llamada sor Margarita de la Cruz.

Hoy hablamos de ella y de esa Corte de Felipe III y Margarita de Austria-Estiria.