A través de denuncias, se ha conocido que la comuna capitalina tiene deudas con muchas instituciones. Por ejemplo, a la empresa Desarrollo Universal S.A de C.V., se le debe más de cinco millones de dólares por el arrendamiento que se hace del edificio donde funciona el Mercado Cuscatlán.
Otra empresa con la que, según las denuncias, se tiene otra deuda millonaria es con Aseo Técnico de San Salvador, ETESSA, empresa que se encarga de recoger los desechos sólidos de varios mercados capitalinos.
Para el concejal Héctor Silva, los endeudamientos se profundizaron en la gestión municipal del actual presidente de la República Nayib Bukele, quien obligó a adquirir compromisos económicos sin mayores análisis.