November 01, 2024

#81 Through the Wire

2 hours 58 minutes

研究所やプロジェクトの外部アドバイザー達とのオンサイトコミュニケーション、SfNポスター、 K99体験談、LLM課金、電子実験ノート談義など。論文はハエ嗅覚系における結合形成作業の“次元削減”、FlyWireの変化球について。 (10/27収録)

Show Notes (番組HP):

NotebookLM

元ラボのポスドクのTweeprintとNotebookLM

のBioRxiv

Neural DynamicsのScientific Advisory Council

Bernard Sabatini

Peter Dayan

Lin Tian

Yao Chen

Mark Anderman

Jeremiah Cohen

Jeremiah が内田さんのところでやった最後の仕事

に対するPeter Dayanの文章："These data nicely muddy the theoretical waters"とかすごい (萩)

Schultz と一緒に仕事してる

Theoretical Neuroscience: Computational And Mathematical Modeling of Neural Systems

SfNにプレリミナリーなアブスト

Nathaniel Daw

Illana Witten

Fedexでポスター印刷するサービス

SfNの特別割引がある(pdf)

元D-labの井上さん

千歳さんラボ

PO: プログラムオフィサー

K99: Pathway to Independence

Kグラント

Rutgersが燃えていたツイートの一例

五十嵐さんリターン回

毎月ミーティングやってるK99出そうとしている人向けのグループ：k99-peer-mentoring-group[at]googlegroups.com

この前録った古館さん回

スクールによってはOpenAIのChatGPT Eduが無料

Cython

Mex

MatlabはバージョンのアップデートでForループが速くなった

PyQt

%##じゃなくて#%%ですね汗

Neurodata Without Borders

GitHubをラボノートブックに

Benchling

ELNの議論

最近のEvernote

DP2

DP5

DP5はVISAは大丈夫そう

論文パート

論文１：Dimensionality reduction simplifies synaptic partner matching in an olfactory circuit

Liqun Luoラボ

種による嗅覚系の違いと共通点に着目したレビュー。違いの原因に関するディスカッションは特に見つからず… (脇)

過去のSema2b発現量操作による軸索の投射経路操作の論文

Toll発現量のグラデ―ションに関する論文

この系で使われている軸索の誘導因子の例、例えばTeneurin

マウスのHippocampusの激シブdevelopment論文

この先報：Teneurinのやつ

宮道さんの昔の仕事

論文２：The fly connectome reveals a path to the effectome

Jonathan Pillow

FlyWire祭り

Motor Cortex祭り

BICCN祭り

2018年にデータ取得は終わっている

Davi Bock (今はThe University of Vermont)

Clay ReidのところでV1のEMリコンストラクションをやっていた

Editorによる序文

Flagship論文 1 2

Neurotransmitterの推定なぜかCellに先に出てた

MorphologyからCell Typeの推定

構造から機能を推定

Sebastian Seung

FlyWireのゲーム

EyeWire論文

Anthony Movshon

にボコられている動画

Samsungにいった?

Mala Murthy

のトラッキングの仕事、例えばこれ

JaneliaのFly Hemi Brain

C Elegansのコネクトーム

*2万5千はJaneliaのHemi Brain、今回は140,000.

8000個のCell Type

*今回のハエはオスでは無くメス

Instrumental Variableの論文

2021年のノーベル経済学賞

0.01%の”Pair”なので、ある細胞に対して他のニューロンが繋がっている確率としてはおよそ1%、と解釈するのが正しそう。 (萩)

SVDはMatrixがNbyNかつsymmetric (Wij = Wji)のとき、eigenvector decompositionとSVDは数学的に完全に等価になります。なので要はSVD、という説明は間違ってなさそうです。(萩)

Light Fieldでハエ全脳の活動を見る

BuzsakiのLog-dynamicl brain

Songさんのシナプス強度のLognormal分布

線虫で全細胞をイメージングしながらオプトで操作普通にNatureでした(萩)

DMDM

IBL

David Rowlandのツイート 1 2

Editorial Notes:

NotebookLMがXのことをTwitterって言ってるのちょっとおもしろい (脇)

K99は通ったわけではない(おそらく落ちてリビジョンする)ので、内容に関しては話半分できいておいて下さい。(萩)

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By NeuroRadio

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November 01, 2024

#81 Through the Wire

2 hours 58 minutes

Show Notes (番組HP):

NotebookLM

元ラボのポスドクのTweeprintとNotebookLM

のBioRxiv

Neural DynamicsのScientific Advisory Council

Bernard Sabatini

Peter Dayan

Lin Tian

Yao Chen

Mark Anderman

Jeremiah Cohen

Jeremiah が内田さんのところでやった最後の仕事

に対するPeter Dayanの文章："These data nicely muddy the theoretical waters"とかすごい (萩)

Schultz と一緒に仕事してる

Theoretical Neuroscience: Computational And Mathematical Modeling of Neural Systems

SfNにプレリミナリーなアブスト

Nathaniel Daw

Illana Witten

Fedexでポスター印刷するサービス

SfNの特別割引がある(pdf)

元D-labの井上さん

千歳さんラボ

PO: プログラムオフィサー

K99: Pathway to Independence

Kグラント

Rutgersが燃えていたツイートの一例

五十嵐さんリターン回

毎月ミーティングやってるK99出そうとしている人向けのグループ：k99-peer-mentoring-group[at]googlegroups.com

この前録った古館さん回

スクールによってはOpenAIのChatGPT Eduが無料

Cython

Mex

MatlabはバージョンのアップデートでForループが速くなった

PyQt

%##じゃなくて#%%ですね汗

Neurodata Without Borders

GitHubをラボノートブックに

Benchling

ELNの議論

最近のEvernote

DP2

DP5

DP5はVISAは大丈夫そう

論文パート

論文１：Dimensionality reduction simplifies synaptic partner matching in an olfactory circuit

Liqun Luoラボ

種による嗅覚系の違いと共通点に着目したレビュー。違いの原因に関するディスカッションは特に見つからず… (脇)

過去のSema2b発現量操作による軸索の投射経路操作の論文

Toll発現量のグラデ―ションに関する論文

この系で使われている軸索の誘導因子の例、例えばTeneurin

マウスのHippocampusの激シブdevelopment論文

この先報：Teneurinのやつ

宮道さんの昔の仕事

論文２：The fly connectome reveals a path to the effectome

Jonathan Pillow

FlyWire祭り

Motor Cortex祭り

BICCN祭り

2018年にデータ取得は終わっている

Davi Bock (今はThe University of Vermont)

Clay ReidのところでV1のEMリコンストラクションをやっていた

Editorによる序文

Flagship論文 1 2

Neurotransmitterの推定なぜかCellに先に出てた

MorphologyからCell Typeの推定

構造から機能を推定

Sebastian Seung

FlyWireのゲーム

EyeWire論文

Anthony Movshon

にボコられている動画

Samsungにいった?

Mala Murthy

のトラッキングの仕事、例えばこれ

JaneliaのFly Hemi Brain

C Elegansのコネクトーム

*2万5千はJaneliaのHemi Brain、今回は140,000.

8000個のCell Type

*今回のハエはオスでは無くメス

Instrumental Variableの論文

2021年のノーベル経済学賞

0.01%の”Pair”なので、ある細胞に対して他のニューロンが繋がっている確率としてはおよそ1%、と解釈するのが正しそう。 (萩)

Light Fieldでハエ全脳の活動を見る

BuzsakiのLog-dynamicl brain

Songさんのシナプス強度のLognormal分布

線虫で全細胞をイメージングしながらオプトで操作普通にNatureでした(萩)

DMDM

IBL

David Rowlandのツイート 1 2

Editorial Notes:

NotebookLMがXのことをTwitterって言ってるのちょっとおもしろい (脇)

K99は通ったわけではない(おそらく落ちてリビジョンする)ので、内容に関しては話半分できいておいて下さい。(萩)

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