В то время как Межзвёздный Альянс готовится нанести сильный контрудар, возле «Вавилона-6» происходит всё больше нападений на марсианские корабли, пытающиеся сбежать из территорий Земного Содружества.

Межзвёздный Альянс был атакован неизвестными флотами. В территориях Лумати и Хурров разворачиваются жестокие бои. Тяжёлая ситуация требует принятия не самых приятных для наших героев решений.

Капитан Келл пропал без вести. И пока на «Вавилоне-6» пытаются организовать его поиски, пираты совершают самое масштабное нападение за свою историю. А марсиане тем временем под руководством Ричарда Муна пытаются организоваться и найти спасение для своей планеты.

Договорённость между «Вавилоном-6» и Землёй вступает в силу, но другие события не дают расслабиться ни на секунду. Капитан Келл срочно отбывает со станции, а рейнджеры пытаются найти пиратов.

Земля проводит операцию «Большой брат», и командный состав «Вавилона-6» вынужден сделать свой выбор: уйти или остаться. Но любой вариант будет иметь свою высокую цену.

Пираты широко раскинули свою паутину закупок вооружения, активно используя чёрный рынок. Рейнджерам предстоит с этим побороться. А тем временем на «Вавилон-6» прибывает делегация Зарафинской Империи.

События в Земном Содружестве и вокруг афаари развиваются слишком быстро, и многие уже начинают терять контроль над ситуацией. И как на зло, на «Вавилоне-6» новая напасть. Нечто проникло на станцию и угрожает её жителям.

Межзвёздный Альянс по-прежнему занят спорами о том, как быть с недавно появившейся на его территориях древней расой Афаари. Ситуация медленно, но верно, накаляется, ставя альянс на порог войны. Однако этого недостаточно. Слишком много игроков действуют скрытно и тайно, не поднимая шума. Техномаг Мальтус из их числа.

Опасные события продолжают развиваться в Земном Содружестве. На этот раз дело касается забытой Луны, на которую отправляется шеф технической службы «Вавилона-6» Алексей Ветров. Совсем не военному неожиданно предстоит влезть в нарастающий конфликт. А тем временем Эндрю Блэк со своим новым скрытным напарником раскрывает загадку, которая до этого была не под силу многим.

Ситуация вокруг афаари медленно, но верно накаляется. А в это время группа молодых ребят желает внести свою лепту в общее дело усиления Межзвёздного Альянса.