El sumo sacerdote Alcimo ordena derribar el muro del atrio interior del Templo que separa el patio de los gentiles del atrio de los judíos, pero cuando comienza la demolición Alcimo cae enfermo y muere en medio de grandes sufrimientos. Tras este acontecimiento, el general sirio Báquides se ve obligado a negociar la paz con Jonatán. Alejandro Epífanes se autoproclama rey de Siria y comienza a reinar en oposición al rey Demetrio. Ambos intentan ganarse el favor de Jonatán, quien sabe sacar partido de las ofertas que le hacen desde los dos bandos. Jonatán es nombrado sumo sacerdote por el rey Alejandro.

Tras la muerte de Judas en el año 160 a.C., Jonatán se pone al frente del pueblo judío hasta el año 142 a.C. Con Jonatán los judíos adquieren tanto la independencia y libertad religiosa como la soberanía política. Jonatán pide a su hermano Juan que acompañe a las mujeres y a los niños, junto con toto el equipamiento, a la tierra de nabateos para ponerlos a salvo. Sin embargo, antes de llegar, los hijos de Yambri matan a Juan y echan mano de todo lo que tenía. Jonatán venga la muerte de su hermano Juan y el general sirio Báquides, al enterarse, se dirige con su ejército a luchar contra Jonatán.

La oposición de Judas a la política y a la maldad del Sumo Sacerdote Alcimo y las acusaciones de este ante el rey ocasionan un nuevo ataque del ejército imperial contra Judá y Jerusalén. El rey Demetrio envía a Nicanor para exterminar al pueblo judío. Judas, una vez más, sale victorioso y decide hacer un pacto con los romanos. Estos firman un tratado de alianza y paz con los judíos. Cuando Demetrio se entera de que Nicanor y su ejército habían caído en combate, envía de nuevo a Báquides y a Alcimo a la tierra de Judá con el mandato de acabar con los judíos. Esta vez Judas Macabeo muere en combate y Jonatán y Simón le dan sepultura en Modín.

Los judíos traidores a la Ley y aliados a los sirios piden la intervención del nuevo rey de Siria, Antíoco V Eupator, ante el intento de Judas de hacerse con el control militar de Jerusalén. El rey reúne a un gran ejército para luchar contra Judas y los suyos. Cuando el ejército del rey estaba a punto de lograr una victoria sobre Judas, Lisias se entera de que Filipo había regresado a Antioquía para dar un golpe de estado. Lisias propone al rey negociar la paz con los judíos y regresar a Antioquía. Mientras tanto, Demetrio, hijo de Seleuco, se proclama rey de Siria y acaba con la vida de Lisias y del rey Antíoco V Eupator. El nuevo rey Demetrio nombra Sumo Sacerdote a Alcimo y gobernador de Judá a Báquides, a quienes ordena vengarse de los hijos de Israel.

Cuando los pueblos vecinos se enteraron de que Judas había reconstruido el altar y dedicado el Santuario como antes, se pusieron muy furiosos y decidieron eliminar a los descendientes de Jacob que vivían en medio de ellos. Judas tomó la decisión de castigar a todos los pueblos que vejaban a los judíos y envió a Simón a liberar a los judíos de Galilea, él y Jonatán fueron a liberar a los que estaban en Galaad y a José y Azarías los dejó en Judá para defenderla. José y Zacarías, al tener noticias de los éxitos de Simón, Judas y Jonatán, desobedecen a Judas y combaten contra los gentiles que les rodeaban. Sufrieron una gran derrota, pero Judas y sus hermanos regresaron y continuaron con las victorias. Cuando el rey Antíoco IV Epífanes es informado de las victorias de Judas se sumerge en una gran tristeza y acaba muriendo.

Cuando Lisias se entera de lo ocurrido se queda perplejo y descorazonado porque los planes con Israel no habían salido como él deseaba ni como el rey le había ordenado. Al año siguiente reúne cinco mil jinetes y sesenta mil soldados para combatir de nuevo contra los judíos. Judas vence a Lisias y sube a Jerusalén para purificar y dedicar el Templo y así poder reanudar el culto.

Al enterarse el rey Antíoco de la derrota de sus hombres, manda reunir un ejército muy poderoso para luchar contra Judas y los suyos. Antíoco va a Persia para recaudar impuestos y pone al frente del reino a Lisias, confiándole también la educación de su hijo Antíoco. Lisias envía a Tolomeo, a Nicanor y a Gorgias a la tierra de Judá con el mandato de destruirla como había ordenado el rey Antíoco. Judas y los suyos se reúnen en el santuario de Mispá, frente a Jerusalén, para invocar la ayuda del Señor. Gorgias toma consigo cinco mil hombres y un millar de jinetes para atacar a los judíos de improviso por la noche, pero Judas y sus hombres se enteran y se enfrentan a ellos alcanzando una gran victoria.

Cuando estaban próximos los días de su muerte, Matatías deja un testamento a sus hijos en el que les exhorta a dar sus vidas por la Alianza de Dios con su pueblo, a confiar en el Señor y a no desfallecer. Tras la muerte de Matatías, su hijo Judas Macabeo toma el mando militar. Judas destaca por su valentía y por su celo por cumplir la Ley de Dios. La forma en que Judas persigue y da muerte a los judíos apóstatas sólo es comprensible en aquella situación histórico-religiosa. Judas vence a Apolonio y a Serón, jefes militares locales del ejército de Siria. Comienza aquí una larga lista de victorias, su fama llegó hasta el rey y todos los gentiles empezaron a hablar de las batallas de Judas.

Matatías y sus hijos decidieron no apostatar de su fe y se marcharon de Jerusalén, estableciéndose en Modín. Pero los emisarios del Rey llegaron también a la ciudad de Modín. Como Matatías era una persona notable por su condición sacerdotal y por su comportamiento, los emisarios del rey le instaron a que fuera el primero en obedecer la orden real de ofrecer sacrificios a los ídolos, asegurándole que, si lo hacía, él y sus hijos serían contados entre los amigos del rey. Matatías se negó aludiendo que él y su familia vivirían conforme a la Alianza, a la Ley y a las costumbres de su pueblo. Así comenzaron las primeras rebeliones de Matatías y los suyos contra los emisarios del rey Antíoco que pretendían obligarles a abandonar la Alianza de Dios con sus padres.

El rey Antíoco IV Epífanes envió a las ciudades de Judá al recaudador jefe de los impuestos. Este se presentó en Jerusalén con un gran ejército, saqueando casas, incendiando la ciudad y destruyendo todo lo que se le ponía por delante. El rey Antíoco, pretendiendo la unidad política de su imperio, decidió implantar sus leyes por la fuerza y abolir las de los judíos, que eran al mismo tiempo religiosas y civiles. Para los judíos, aceptar las leyes de Antíoco suponía la apostasía formal de su religión, con todo lo que ello implicaba. Erigieron una estatua de Zeus Olímpico en el Templo de Jerusalén y quemaron todos los libros de la Ley que encontraron. Sin embargo, muchos judíos en Israel se mantuvieron firmes y prefirieron morir antes que apostatar de su fe.