Ilmu pengetahuan dan teknologi terutama pada zaman modern ini, mengalami  banyak perubahan dan sangat cepat, sedang agama bergerak dengan lamban  sekali, karena itu terjadi ketidak harmonisan antara agama dan ilmu  pengetahuan serta teknologi. Dalam ensiklopedi Agama dan filsafat  dijelaskan bahwa Islam adalah agama Allah yang diperintahkan-Nya untuk  mengajarkan tentang pokok-pokok serta peraturan-peraturannya kepada Nabi  Muhammad saw. dan menugaskannya untuk menyampaikan agama tersebut  kepada seluruh manusia dengan mengajak mereka untuk memeluknya. 

Salah  satu ciri yang membedakan Islam dengan yang lainnya adalah penekanannya  terhadap ilmu (sains). Al-Qur’an dan Al-Sunnah mengajak kaum muslimin  untuk mencari dan mendapatkan ilmu dan kearifan, serta menempatkan  orang-orang yang berpengatahuan pada derajat yang tinggi. Apabila kita  memperhatikan ayat al-Qur’an mengenai perintah menuntut ilmu kita akan  temukan bahwa perintah itu bersifat umum, tidak terkecuali pada  ilmu-ilmu yang disebut ilmu agama, yang ditekankan dalam al-Qur’an  adalah apakah ilmu itu bermanfaat atau tidak. Adapun kriteria ilmu yang  bermanfaat adalah ilmu yang ditujukan untuk mendekatkan diri kepada sang  khalik sebagai bentuk pengabdian kepada-Nya. 

Pertemuan kaum muslimin  dengan dunia modern, melahirkan berbagai aliran pemikiran, seperti  aliran salaf dengan semboyan “Kembali kepada al-Qur’an dan Sunnah”, dan  aliran Tajdid dengan semboyan “maju ke depan bersama al-Qur’an”.  Pembaruan dalam Islam memang sangat dianjurkan selama pembaruan itu  tidak mengebiri ajaran-ajaran Islam yang otentik, akan tetapi justru  memperkuat, mempertinggi dan mengangkat martabat ummat Islam dihadapan  bangsa-bangsa lain di dunia.

Melek ilmu telah sejak dini dikenalkan dalam dunia Islam. Berbagai  lembaga pendidikan lahir untuk memenuhi kepentingan ini. Salah satunya  adalah maktab atau  sering pula dikenal sebagai kuttab. Melalui maktab, sejumlah bidang ilmu  diajarkan kepada para siswanya, misalnya tata bahasa dan Alquran.

Andalusia (bahasa Spanyol: Andalucía) adalah sebuah komunitas otonomi Spanyol.  Andalusia adalah wilayah otonomi paling padat penduduknya dan kedua  terbesar dari 17 wilayah yang membentuk Spanyol. Ibu kotanya adalah Sevilla.

Andalusia terletak di Semenanjung Iberia bagian selatan, di utara dibatasi oleh komunitas otonom Extremadura dan Castilla-La Mancha; di sebelah timur oleh komunitas otonom Murcia dan Laut Mediterania; di sebelah barat oleh Portugal dan Samudra Atlantik; di sebelah selatan oleh Laut Mediterania dan Selat Gibraltar di mana memisahkan Spanyol dengan Maroko. Juga di selatan berbatasan dengan Gibraltar, koloni Britania Raya.

Nama Andalusia berasal dari nama bahasa Arab "Al Andalus", yang merujuk kepada bagian dari jazirah Iberia yang dahulu berada di bawah pemerintahan Muslim. Sejarah Islam Spanyol dapat ditemukan di pintu masuk al-Andalus. Tartessos,  ibu kota dari Peradaban Tartessos yang dahulu besar dan berkuasa,  terletak di Andalusia, dan dikenal di dalam Alkitab dengan nama Tarsus.  Lebih banyak informasi tentang wilayah ini dapat ditemukan dalam entri Hispania Baetica, nama provinsi Romawi yang dahulu terletak di wilayah ini.

Budaya Andalusia sangat dipengaruhi oleh pemerintahan Muslim di wilayah itu selama  delapan abad, yang berakhir pada 1492 dengan penaklukan kembali atas  Granada oleh raja dan ratu Katolik.

Dari sumber-sumber Barat diperoleh catatan bahwa pada abad ke XVI sejumlah daerah di Papua bagian barat, yakni wilayah-wilayah Waigeo, Missool, Waigama, dan Salawati tunduk kepada kekuasaan Sultan Bacan di Maluku. Berdasarkan cerita populer dari masyarakat Islam Sorong dan Fakfak, agama Islam masuk di Papua sekitar abad ke 15 yang dilalui oleh pedagang–pedagang muslim. Perdagangan antara lain dilakukan oleh para pedagang–pedagang suku Bugis melalui Banda (Maluku Tengah) dan oleh para pedagang Arab dari Ambon yang melalui Seram Timur.

Selain melalui jalur perdagangan, di daerah Merauke Islam dikenal melalui perantara orang-orang buangan yang beragama Islam, yang berasal dari Sumatra, Kalimantan, Maluku dan Jawa. Terdapat istilah yang populer di Merauke, yaitu "Jamer" (dari kata Jawa-Merauke), untuk menyebut orang-orang keturunan Jawa baik yang merupakan keturunan orang-orang yang dipindahkan pada zaman penjajahan Belanda ataupun keturunan penduduk program transmigrasi pada masa setelah kemerdekaan Indonesia.

1760 di bawah kekuasaan kolonial Belanda, ada beberapa orang Muslim asal Ternate, Makiang dan Ambon datang bermukim di Manado. Kemudian pada 1770 mulai berdatangan Muslim dari Jawa Tengah, Jogjakarta dan Jawa Timur sehingga mereka menetap dan memberi nama desa Suraya (jenis tumbuhan yang tumbuh di wilayah ini) dan sekarang namanya Kampung Islam,” ujar Hamzah.

Dijelaskannya pada tahun 1776 mereka membuat tempat ibadah bersifat darurat berbentuk Langgar, berlantaikan tanah, atap daun rumbia serta dinding anyaman bambu. Orang Muslim mulai berdatangan dari Sumatra Barat, Sumatra Selatan, Sulawesi serta Jamaah dari Yaman Hadra Maud.

Mereka berprofesi sebagai pedagang, guru mengajar membaca Al-Quran, Maulida, Barzanji, Handra, Samrah dan bela diri pencak silat. “Semua budaya itu masih terpelihara sampai sekarang” tuturnya.

Kerajaan Tanah Hitu adalah sebuah kerajaan Islam yang terletak di Pulau Ambon, Maluku. Kerajaan ini memiliki masa kejayaan antara 1470-1682 dengan raja pertama yang bergelar Upu Latu Sitania (raja tanya) karena Kerajaan ini didirikan oleh Empat Perdana yang ingin mencari tahu faedah baik dan tidak adanya Raja. 

Kerajaan Tanah Hitu pernah menjadi pusat perdagangan rempah-rempah dan memainkan peran yang sangat penting di Maluku, disamping melahirkan intelektual dan para pahlawan pada zamannya. Beberapa di antara mereka misalnya adalah Imam Ridjali, Tagglukabessy, Kakiali dan lainnya yang tidak tertulis di dalam Sejarah Maluku sekarang, yang beribu Kota Negeri Hitu. Kerajaan ini berdiri sebelum kedatangan imprialisme barat ke wilayah Nusantara.

Islam masuk di pulau Lombok kira-kira abad ke-16 M, diperkenalkan oleh Sunan Prapen (Sayyid Maulana Muhammad Fadlullah), putra Sunan Giri (salah satu Wali Songo). Maka setelah kedatangannya, masyarakat Lombok yang tadinya beragama Hindu-Jawa, beralih ke agama Islam.” Deskripsi tentang sejarah masuknya Islam ke Lombok dapat menjelaskan kenapa Islam di Lombok dapat terbagi menjadi dua jenis praktik keagamaan—Islam Waktu Lima (W5) dan Islam Wetu Telu (W3). Namun sebelum masuk ke sana, kita akan membahas dulu masyarakat Lombok pra-Islam. Sebab, hal ini juga penting, karena gambaran masyarakat Lombok pra-Islam lah yang akan mewarnai corak Islam Wetu Telu di masa kini.

Islam masuk ke Bali diperkirakan pada abad ke-13 dan 14 melalui Kerajaan Gelgel, tetapi tepatnya belum ada penelitian yang pasti. Penelitian tentang asal muasal Islam di Bali masih terhitung langka. Sangat sulit untuk mendapatkan sumber tertulis mengenai sejarah masuknya Islam ke pulau Bali pertama kali.

Namun beberapa sejarawan melacak keberadaan Islam di Bali melalui tradisi lisan dan adanya berbagai komunitas Islam yang ada di berbagai daerah di Bali. Melalui penelitian di berbagai komunitas muslim di Bali dapat diketahui kapan Islam mulai memasuki daearah tersebut, antara lain melalui penelitian masjid-masjid tua yang dibangun dan makam-makam kuno dari pemuka Islam di daerah tersebut yang sekarang juga dikenal dengan sebutan Wali Pitu dari Bali.

Kesultanan Tidore adalah kerajaan Islam yang berpusat di wilayah Kota Tidore, Maluku Utara, Indonesia sekarang. Pada masa kejayaannya (sekitar abad ke-16 sampai abad ke-18), kerajaan ini menguasai sebagian besar Pulau Halmahera selatan, Pulau Buru, Pulau Seram, dan banyak pulau-pulau di pesisir Papua barat.

Pada tahun 1521, Sultan Mansur dari Tidore menerima Spanyol sebagai sekutu untuk mengimbangi kekuatan Kesultanan Ternate saingannya yang bersekutu dengan Portugal. Setelah mundurnya Spanyol dari wilayah tersebut pada tahun 1663 karena protes dari pihak Portugal sebagai pelanggaran terhadap Perjanjian Tordesillas 1494, Tidore menjadi salah satu kerajaan paling merdeka di wilayah Maluku. Terutama di bawah kepemimpinan Sultan Saifuddin (memerintah 1657-1689), Tidore berhasil menolak pengusaan VOC terhadap wilayahnya dan tetap menjadi daerah merdeka hingga akhir abad ke-18.

Kesultanan Ternate atau juga dikenal dengan Kerajaan Gapi adalah salah satu dari 4 kerajaan Islam di Kepulauan Maluku dan merupakan salah satu kerajaan Islam tertua di Nusantara. Didirikan oleh Baab Mashur Malamo pada tahun 1257. Kesultanan Ternate memiliki peran penting di kawasan timur Nusantara antara abad ke-13 hingga abad ke-19. 

Kesultanan Ternate menikmati kegemilangan di paruh abad ke-16 berkat perdagangan rempah-rempah dan kekuatan militernya. Pada masa jaya kekuasaannya membentang mencakup wilayah Maluku, Sulawesi bagian utara, timur dan tengah, bagian selatan kepulauan Filipina hingga sejauh Kepulauan Marshall di Pasifik.